186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6113 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  100 
 
 		 295 aa  606  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  75 
 
 		 304 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  72.97 
 
 		 314 aa  463  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  75 
 
 		 304 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  75 
 
 		 312 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  74.4 
 
 		 302 aa  457  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  74.66 
 
 		 327 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  73.09 
 
 		 305 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  72.6 
 
 		 304 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  74.4 
 
 		 302 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  71.33 
 
 		 313 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  70.76 
 
 		 305 aa  441  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  69.15 
 
 		 302 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  68.71 
 
 		 312 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  65.78 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  65.05 
 
 		 290 aa  394  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  59.17 
 
 		 296 aa  346  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  50.54 
 
 		 287 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  51.8 
 
 		 302 aa  275  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  49.46 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  47.31 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  49.13 
 
 		 290 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  40 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  40.35 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  38.97 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  38.97 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  38.97 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  41.52 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  40.15 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  40.15 
 
 		 271 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  38.28 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  38.28 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  37.93 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  41.2 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  39.27 
 
 		 310 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  37.94 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  40.14 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  37.86 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  39.35 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  37.59 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  40.15 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  36.65 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  36.43 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  37.68 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  35.52 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  33.57 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  36.61 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  36.43 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  36.73 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  38.13 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  35.62 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  39.7 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  39.7 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  34.46 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  39.33 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  37.14 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  35.23 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  37.18 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  33.92 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  36.14 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  36.23 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  33.68 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  38.32 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  33.81 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  34.77 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  38.23 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  33.8 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  36.3 
 
 		 311 aa  148  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  34.98 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  38.55 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  35.38 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  31.36 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  32.73 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  32.04 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  31.84 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  34.29 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  31.87 
 
 		 280 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  34.3 
 
 		 281 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  32.6 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  32.47 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  32.59 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  32.59 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  32.23 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  37.45 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  34.93 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  34.91 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  31.67 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  34.32 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  33.58 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  33.2 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  34.19 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  34.04 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  29.63 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  37.97 
 
 		 198 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  29.08 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  37.97 
 
 		 198 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  31.5 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  34.17 
 
 		 324 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  34.17 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>