176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2797 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  100 
 
 		 284 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  63.77 
 
 		 281 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  59.06 
 
 		 277 aa  341  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  58.06 
 
 		 280 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  58.78 
 
 		 280 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  49.45 
 
 		 306 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  49.45 
 
 		 306 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  51.47 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  47.57 
 
 		 295 aa  255  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  48.54 
 
 		 298 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  42.55 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  45.45 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  43.32 
 
 		 297 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  46.27 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  45.15 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  45.05 
 
 		 296 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  45.05 
 
 		 296 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  45.05 
 
 		 296 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  45.05 
 
 		 296 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  45.05 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  41.99 
 
 		 368 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  41.99 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  41.99 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  45.05 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  41.99 
 
 		 330 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  41.99 
 
 		 330 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  41.99 
 
 		 330 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  41.99 
 
 		 330 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  41.54 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  39.93 
 
 		 274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  44.57 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  40.57 
 
 		 277 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  47.54 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0581  hypothetical protein  34.57 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0660  hypothetical protein  34.2 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0270681  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  38.32 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  36.7 
 
 		 266 aa  152  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  35 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  35.77 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  35.77 
 
 		 275 aa  149  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  35.4 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  35.25 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  35.27 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  35.79 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  33.21 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  33.57 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3775  amidohydrolase 2  35.02 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0945116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  34.04 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3800  amidohydrolase 2  39.33 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  33.69 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  31.77 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  31.51 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  34.29 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  32.59 
 
 		 296 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  32.61 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  34.29 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  31.69 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  33.68 
 
 		 302 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  31.9 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  30.29 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  35.44 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  32.36 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  33.1 
 
 		 313 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  32.98 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  34.38 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  33.57 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  29.52 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  33.1 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  33.69 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  31.99 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  32.86 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  32.65 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  27.62 
 
 		 320 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  34.4 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  32.18 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  30 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  29.45 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  29.39 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  29.6 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  31.88 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  32.33 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  30.4 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  32.37 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  29.37 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  30.63 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  30 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  29.86 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  35.79 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  32.79 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  29.3 
 
 		 310 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  28.06 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  29.67 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  29.67 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  29.67 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  35.62 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  30.93 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  29.89 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  27.56 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>