154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1252 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  100 
 
 		 277 aa  563  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  56.93 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  46.13 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  46.84 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  48.36 
 
 		 303 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  45.15 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  45.15 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  44.77 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  46.47 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  42.38 
 
 		 330 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  42.38 
 
 		 368 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  42.38 
 
 		 330 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  42.38 
 
 		 330 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  42.38 
 
 		 327 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  42.38 
 
 		 330 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  40.57 
 
 		 284 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  42.38 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  42.59 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  43.82 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  46.74 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  42.49 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  43.07 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  40.5 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  42.12 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  41.76 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  41.76 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  41.76 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  41.76 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  40.5 
 
 		 280 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  40.89 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  39.63 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  41.48 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  42.31 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  41.3 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0660  hypothetical protein  35.69 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0270681  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0581  hypothetical protein  35.69 
 
 		 265 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  34.67 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  32.96 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  32.96 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  32.21 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3800  amidohydrolase 2  40.24 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  33.7 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  35.82 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  33.96 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  34.7 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  37.04 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  33.21 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  34.4 
 
 		 289 aa  118  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  30.22 
 
 		 290 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  32.71 
 
 		 294 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3775  amidohydrolase 2  31.66 
 
 		 281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0945116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  32.53 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  33.71 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  37.35 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  30.48 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  32.86 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  31.11 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  29.79 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  28 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  30.51 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  32.28 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  31.37 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  29.3 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  30.4 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  30.83 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  27.99 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  29.89 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  30.07 
 
 		 304 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  29.45 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  28.31 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  31.23 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  30.58 
 
 		 302 aa  99  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  30.51 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  28.51 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  25.83 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  28.25 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  30.93 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  29.96 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  30.37 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  31.56 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  32.01 
 
 		 308 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 312 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  26.87 
 
 		 323 aa  95.5  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  32.24 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  30.71 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  29.71 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  32.61 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  30.29 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  30.71 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  27.72 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  31.88 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  31.16 
 
 		 311 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  30.71 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>