188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4148 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  100 
 
 		 297 aa  597  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  52.82 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  52.82 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  52.82 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  52.82 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  52.82 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  52.82 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  52.82 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  52.11 
 
 		 308 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  52.99 
 
 		 296 aa  281  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  49.82 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  49.82 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  51.66 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  52.03 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  51.66 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  51.66 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  51.66 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  51.66 
 
 		 295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  50.19 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  43.32 
 
 		 284 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  48.55 
 
 		 282 aa  237  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  46.24 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  48.31 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  46.67 
 
 		 303 aa  228  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  50.73 
 
 		 299 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  48.5 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  44.7 
 
 		 295 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  41.61 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  39.71 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  40.88 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  43.82 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  39.78 
 
 		 277 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  45.45 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  41.6 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0581  hypothetical protein  32.84 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0660  hypothetical protein  32.47 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0270681  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  33.79 
 
 		 289 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  40.53 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  33.83 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  34.55 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  39.18 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3775  amidohydrolase 2  37.72 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0945116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  37.64 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  36.43 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  34.44 
 
 		 286 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  30.77 
 
 		 320 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3800  amidohydrolase 2  42.13 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  36 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  35 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  31.36 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  36.3 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  32.71 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  29.97 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  33.96 
 
 		 310 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  33.96 
 
 		 310 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  33.89 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  31.94 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  36.13 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  32.84 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  37.45 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  33.21 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  33.58 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  30.6 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  30.6 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  33.7 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  31.46 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  33.21 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  30.97 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  32.92 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  33.47 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  30.86 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  34.07 
 
 		 275 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  31.48 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  31.34 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  33.47 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  31.37 
 
 		 282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  34.07 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  32.27 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  32.26 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  32.37 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  31.67 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  31.2 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  32.26 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  31.29 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  30.34 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  31.84 
 
 		 274 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  30.48 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  31.33 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  31.85 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  34.45 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  31.87 
 
 		 304 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  30.74 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  30.37 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  33.87 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>