155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1280 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  100 
 
 		 291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  88.58 
 
 		 295 aa  519  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  74.11 
 
 		 300 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  72.92 
 
 		 289 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  58.55 
 
 		 300 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  54.38 
 
 		 289 aa  301  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  54.38 
 
 		 275 aa  301  9e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  54.01 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  47.2 
 
 		 289 aa  251  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  47.17 
 
 		 286 aa  236  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  40.42 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  41.46 
 
 		 287 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  40.14 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  38.36 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  42.28 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  41.16 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  40.49 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  38.89 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  40.79 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  39.56 
 
 		 312 aa  191  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  37.41 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  40.44 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  38.81 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  39.55 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  39.71 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  38.75 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  36.4 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  36.03 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  36.03 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  34.93 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  36.36 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  34.38 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  36.65 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  33.81 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  39.85 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  35.4 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  35.19 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  33.92 
 
 		 313 aa  168  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  34.27 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  34.27 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  34.97 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  33.21 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  34.29 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  34.62 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  36.17 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  34.27 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  35.64 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  35.76 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  33.79 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  37.85 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  34.52 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  36.26 
 
 		 321 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  41.95 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  37.31 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  38.63 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  32.5 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  40 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  40.07 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  36.19 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  35.82 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  35.29 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  36.59 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  38.75 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  38.75 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  35.07 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  40.21 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  38.15 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  39.26 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  39.18 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  38.89 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  38.89 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  38.89 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  39.03 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  38.89 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  37.78 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  38.41 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  35.59 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  36 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  37.41 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  35.17 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  33.96 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  36.96 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  36.94 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  37.73 
 
 		 368 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  38.52 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  37.73 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  37.73 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  38.52 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  37.73 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  37.73 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  37.73 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  37.73 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  35.21 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  38.83 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  35.34 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  35.34 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  37.22 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>