151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1365 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  100 
 
 		 287 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  86.06 
 
 		 287 aa  524  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  56.2 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  49.46 
 
 		 295 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  46.43 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  45.99 
 
 		 290 aa  266  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  47.54 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  47.18 
 
 		 327 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  46.43 
 
 		 302 aa  258  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  46.48 
 
 		 312 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  46.32 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  46.48 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  47.37 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  45.14 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  46.48 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  47.02 
 
 		 305 aa  252  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  44.41 
 
 		 305 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  44.41 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  46.32 
 
 		 313 aa  248  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  46.59 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  41.2 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  42.55 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  40.42 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  39.79 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  42.7 
 
 		 286 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  40.42 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  37.94 
 
 		 294 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  39.44 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  40.77 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  38.6 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  37.04 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  37.04 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  37.04 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  38.85 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  38.73 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  36.14 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  38.23 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  37.32 
 
 		 286 aa  185  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  36.13 
 
 		 286 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  34.93 
 
 		 295 aa  181  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  35.64 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  35.64 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  35.64 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  35.14 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  36.13 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  36.23 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  35.51 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  34.74 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  35.51 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  35.49 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  33.09 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  34.66 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  31.94 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  35.34 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  36.63 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  34.04 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  33.83 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  31.84 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  34.04 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  35.38 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  31.05 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  32.58 
 
 		 271 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  35.46 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  34.57 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  31.34 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  32.26 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  34.31 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  31.52 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  32.12 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  32.21 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  36.12 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  32.09 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  32.09 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 274 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  32.09 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  32.46 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  32.46 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  31.65 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  33.08 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  33.08 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  32.12 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  32.71 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  31.11 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  32.71 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  32.71 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  32.71 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  30.22 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  32.61 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  33.96 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  33.21 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  33.96 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  29.97 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  28.26 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  31.48 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  30.97 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  32.72 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  32.71 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  32.36 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>