150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4571 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  100 
 
 
272 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  62.26 
 
 
271 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  61.51 
 
 
271 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  60.07 
 
 
293 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  60.07 
 
 
293 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  60.07 
 
 
293 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  58.78 
 
 
274 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  42.64 
 
 
310 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  42.64 
 
 
310 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  41.89 
 
 
310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  43.7 
 
 
312 aa  228  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  41.13 
 
 
310 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  42.05 
 
 
312 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  43.61 
 
 
287 aa  222  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  40.89 
 
 
297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  40.53 
 
 
315 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  39.85 
 
 
321 aa  214  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  40.52 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  40.15 
 
 
282 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  42.86 
 
 
296 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  41.35 
 
 
308 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  38.75 
 
 
287 aa  201  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  38.72 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  37.31 
 
 
301 aa  191  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  38.83 
 
 
273 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  38.72 
 
 
286 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  39.39 
 
 
290 aa  185  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  40.52 
 
 
311 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  39.7 
 
 
320 aa  185  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  36.6 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  34.96 
 
 
275 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  34.96 
 
 
289 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  34.59 
 
 
289 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  40.15 
 
 
294 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  37.31 
 
 
289 aa  178  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  38.89 
 
 
302 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  36.6 
 
 
290 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  36.43 
 
 
295 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  34.94 
 
 
283 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  38.26 
 
 
286 aa  168  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  33.08 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  34.07 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
296 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  34.33 
 
 
290 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  35.47 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  34.42 
 
 
327 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  35.21 
 
 
290 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  35.11 
 
 
325 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  33.95 
 
 
302 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  31.84 
 
 
287 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  36.03 
 
 
295 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  33.09 
 
 
307 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  33.83 
 
 
300 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  35.14 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
291 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  32.21 
 
 
287 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
304 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  35.23 
 
 
289 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  31.64 
 
 
312 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  31.72 
 
 
323 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  32.14 
 
 
314 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  37.64 
 
 
290 aa  149  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  31.39 
 
 
304 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
312 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  30.85 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  32.48 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  32.61 
 
 
313 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  33.83 
 
 
300 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  31.88 
 
 
304 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  32.71 
 
 
295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  33.09 
 
 
295 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  31.16 
 
 
302 aa  138  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  31.44 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  32.73 
 
 
296 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  32.46 
 
 
296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  40.12 
 
 
198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  40.12 
 
 
198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  34.59 
 
 
274 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  31.46 
 
 
298 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  28.78 
 
 
296 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  30.51 
 
 
306 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  30.51 
 
 
306 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  31.6 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  32.14 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  30.6 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  31.6 
 
 
327 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  31.6 
 
 
330 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  31.6 
 
 
330 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  31.6 
 
 
330 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  31.6 
 
 
324 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  31.6 
 
 
330 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  31.6 
 
 
368 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  30.86 
 
 
318 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  33.71 
 
 
276 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  28.79 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  29 
 
 
303 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
277 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  29.56 
 
 
281 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>