159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4374 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  100 
 
 
312 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  79.33 
 
 
305 aa  507  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  76.14 
 
 
312 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  76.41 
 
 
304 aa  497  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  76.67 
 
 
304 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  72.58 
 
 
314 aa  491  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  77.52 
 
 
302 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  76 
 
 
304 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  74.03 
 
 
313 aa  487  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  75.33 
 
 
327 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  73.58 
 
 
302 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  72 
 
 
305 aa  461  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  72.91 
 
 
307 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  70.67 
 
 
302 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  68.71 
 
 
295 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  58.5 
 
 
290 aa  358  5e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  54.3 
 
 
296 aa  323  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  46.83 
 
 
287 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  46.48 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  46.45 
 
 
302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  41.84 
 
 
323 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  42.52 
 
 
290 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  37.14 
 
 
275 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  37.14 
 
 
289 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  37.14 
 
 
289 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  36.93 
 
 
300 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  36.62 
 
 
294 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  37.72 
 
 
312 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  36.55 
 
 
310 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  36.54 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  35.52 
 
 
310 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  35.52 
 
 
310 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  35.52 
 
 
310 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  37.19 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  36.01 
 
 
289 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  38.73 
 
 
274 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  35.4 
 
 
286 aa  176  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  35.64 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  35.27 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  36.49 
 
 
296 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  34.95 
 
 
309 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  34.25 
 
 
304 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  34.87 
 
 
296 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  33.79 
 
 
300 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  34.41 
 
 
295 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  34.4 
 
 
306 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  35.84 
 
 
282 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  32.04 
 
 
286 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  31.93 
 
 
283 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  32.44 
 
 
320 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  35.4 
 
 
296 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  34.75 
 
 
273 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  33.68 
 
 
297 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  33.33 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  35.29 
 
 
290 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  32.89 
 
 
295 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  31.64 
 
 
272 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  32.18 
 
 
321 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  35.53 
 
 
293 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  35.53 
 
 
293 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  35.53 
 
 
293 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  34.39 
 
 
315 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  32.86 
 
 
290 aa  148  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
295 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  31.34 
 
 
286 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  31.49 
 
 
287 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  35.37 
 
 
311 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  31.42 
 
 
325 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  31.38 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  30.5 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  32.16 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  32.87 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  32.76 
 
 
320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  40.48 
 
 
198 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  40.48 
 
 
198 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  30.94 
 
 
281 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  30.34 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
277 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  31.39 
 
 
295 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  30.66 
 
 
306 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  30.66 
 
 
306 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  32.51 
 
 
290 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
284 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  29.51 
 
 
287 aa  122  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  30.77 
 
 
285 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  30 
 
 
280 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  31.32 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  30.48 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  30.48 
 
 
327 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  28.78 
 
 
301 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  31.07 
 
 
330 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  30.48 
 
 
368 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  31.07 
 
 
330 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  31.07 
 
 
330 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  31.07 
 
 
330 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  31.56 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  30.11 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  34.01 
 
 
291 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>