164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4835 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  100 
 
 
303 aa  590  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  63.12 
 
 
298 aa  358  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  53.14 
 
 
306 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  53.14 
 
 
306 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  55.29 
 
 
302 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  52.92 
 
 
282 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  51.09 
 
 
330 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  51.09 
 
 
330 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  51.09 
 
 
330 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  51.09 
 
 
330 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  51.09 
 
 
324 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  51.09 
 
 
327 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  51.09 
 
 
368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  55.35 
 
 
296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  54.61 
 
 
296 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  54.61 
 
 
296 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  54.61 
 
 
296 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  54.61 
 
 
295 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  54.61 
 
 
296 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  49.64 
 
 
308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  48.5 
 
 
295 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  50.93 
 
 
291 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  53.73 
 
 
304 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  54.01 
 
 
299 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  49.26 
 
 
296 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  42.55 
 
 
284 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  46.38 
 
 
281 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  45.65 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  45.29 
 
 
277 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  44.57 
 
 
280 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  43.38 
 
 
274 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  46.67 
 
 
297 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  48.36 
 
 
277 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  40.75 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0660  hypothetical protein  33.09 
 
 
265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0270681  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0581  hypothetical protein  33.09 
 
 
265 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  40.89 
 
 
300 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  37.13 
 
 
289 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  37.13 
 
 
275 aa  165  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  36.76 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3775  amidohydrolase 2  39.07 
 
 
281 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0945116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  41.61 
 
 
289 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  40.22 
 
 
295 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  40.21 
 
 
291 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  38.89 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  39.27 
 
 
300 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  30.53 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  34.8 
 
 
296 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  37.94 
 
 
296 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  34.94 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  35.21 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3800  amidohydrolase 2  36.86 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  34.19 
 
 
312 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  31.25 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  32.59 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  32.96 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  31.25 
 
 
286 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  34.32 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  35.42 
 
 
294 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  34.07 
 
 
296 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
275 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  33.45 
 
 
312 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
287 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  32.3 
 
 
290 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  30.97 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  32.3 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  30.37 
 
 
321 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  32.96 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  29.82 
 
 
290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  29.48 
 
 
310 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
311 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  33.94 
 
 
306 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  30.29 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  32.37 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  31.84 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  28.36 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  30 
 
 
282 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  28.73 
 
 
310 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  28.73 
 
 
310 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  34.43 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  28.36 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  34.04 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  32.22 
 
 
276 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  31.62 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  29 
 
 
272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  33.09 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  33.73 
 
 
318 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  31.27 
 
 
313 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  28.31 
 
 
279 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  31.6 
 
 
305 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  30.63 
 
 
286 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  29.41 
 
 
289 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  31.43 
 
 
314 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  31.5 
 
 
290 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  31.9 
 
 
302 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  31.9 
 
 
273 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  31.27 
 
 
274 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  30.51 
 
 
275 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  35.16 
 
 
290 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  35.17 
 
 
295 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>