168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4079 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  100 
 
 		 266 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  41.64 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  41.64 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  40.53 
 
 		 297 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3800  amidohydrolase 2  45.75 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  40.37 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  40.37 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  40.37 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  40.37 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  40.37 
 
 		 296 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  40 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  40.52 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  36.7 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  38.91 
 
 		 282 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  40 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  38.89 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  38.06 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  37.78 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  36.64 
 
 		 272 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  38.89 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  37.82 
 
 		 296 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  36.88 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  36.3 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  40.59 
 
 		 277 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  36.3 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  36.3 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  36.3 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  36.3 
 
 		 324 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  36.3 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  36.3 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  35.85 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  40.66 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  38.75 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  38.06 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  35.34 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  36.03 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  36.03 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  35.66 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  35.82 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  37.45 
 
 		 290 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  33.95 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  33.21 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  32.59 
 
 		 309 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  35.4 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  32.25 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  32.49 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  33.46 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  31.34 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  33.96 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  30.8 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  35.61 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  33.21 
 
 		 306 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  31.32 
 
 		 310 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  31.32 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  31.32 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  33.46 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  31.82 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0660  hypothetical protein  27.14 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0270681  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  32.5 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  31.09 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  33.94 
 
 		 304 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  31.1 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  32.27 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  33.08 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  32.03 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0581  hypothetical protein  26.39 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  31.65 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  31.56 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  34.55 
 
 		 295 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  32.23 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  30.91 
 
 		 302 aa  99.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  31.23 
 
 		 297 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  31.41 
 
 		 327 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  30.53 
 
 		 314 aa  99  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  31.18 
 
 		 302 aa  98.6  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  31.11 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  30.96 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  32.62 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  30.96 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  30.14 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  34.42 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  36.56 
 
 		 289 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  29.3 
 
 		 286 aa  95.9  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  35.77 
 
 		 311 aa  95.5  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  30.96 
 
 		 313 aa  95.5  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  31.5 
 
 		 295 aa  95.5  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  32.03 
 
 		 325 aa  95.1  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  32.38 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  29.32 
 
 		 271 aa  92  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  32.35 
 
 		 283 aa  92  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  32.46 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  31.77 
 
 		 290 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  30.22 
 
 		 280 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  32.1 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  32.73 
 
 		 300 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  26.97 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  29.48 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  27.62 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>