128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2493 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2493  amidohydrolase 2  100 
 
 		 254 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0708  amidohydrolase 2  57.48 
 
 		 268 aa  289  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63573e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0697  amidohydrolase 2  57.48 
 
 		 268 aa  288  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1983  amidohydrolase 2  56.56 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.554072  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2127  hypothetical protein  58.2 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2276  amidohydrolase 2  57.32 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3758  hypothetical protein  60.41 
 
 		 249 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2101  hypothetical protein  56.97 
 
 		 253 aa  281  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2022  putative lactonase  53.69 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.244849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1722  amidohydrolase 2  60.82 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0172  amidohydrolase family protein  52.87 
 
 		 252 aa  275  6e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.222028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0457  amidohydrolase 2  58.37 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1876  amidohydrolase 2  54.07 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0123209  normal  0.0185409 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  36.33 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  36.33 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  35.09 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  36.33 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  32.74 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  32.89 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  32.89 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  32.89 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  40.79 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  32.06 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  33.98 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  33.98 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  33.98 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  31.82 
 
 		 300 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  31.42 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  34.84 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  31.89 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  35.96 
 
 		 302 aa  95.5  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 312 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  40.56 
 
 		 198 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  40.56 
 
 		 198 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  33.51 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  31.85 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  28.1 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  29.12 
 
 		 291 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  32.13 
 
 		 282 aa  85.9  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  31.22 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  30.29 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  32.95 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  35.26 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  31.15 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  27.44 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  29.86 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  33.47 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  27.8 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  27.01 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  30.57 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  30.7 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  35.9 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  27.64 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  31.66 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  28.84 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  29.84 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  30.47 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  26.69 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  31.44 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  26.02 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  30.22 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  28.46 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  27.34 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  25.54 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  28.3 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  28.79 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  30.47 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  32.61 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  29.6 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  30.67 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  28.86 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  28.79 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  27.55 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  30.56 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  29.44 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  25.36 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  27.51 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  27.34 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  31.87 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  28.79 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  29.49 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  29 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  28.51 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  31.61 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  31.36 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  32.5 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  32.5 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  27.68 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  26.2 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  29.37 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>