126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1876 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1876  amidohydrolase 2  100 
 
 
255 aa  502  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0123209  normal  0.0185409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0457  amidohydrolase 2  55.92 
 
 
254 aa  264  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1722  amidohydrolase 2  55.51 
 
 
248 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164303  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2276  amidohydrolase 2  53.04 
 
 
260 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3758  hypothetical protein  54.29 
 
 
249 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0697  amidohydrolase 2  51.84 
 
 
268 aa  250  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146156  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2127  hypothetical protein  50.21 
 
 
253 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0708  amidohydrolase 2  51.84 
 
 
268 aa  247  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63573e-27 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2101  hypothetical protein  48.58 
 
 
253 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1983  amidohydrolase 2  46.91 
 
 
247 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.554072  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2493  amidohydrolase 2  54.07 
 
 
254 aa  228  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2022  putative lactonase  46.91 
 
 
252 aa  228  8e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.244849  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0172  amidohydrolase family protein  46.5 
 
 
252 aa  223  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.222028  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  36.17 
 
 
293 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  36.17 
 
 
293 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  36.17 
 
 
293 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  32.94 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  30.26 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  30.26 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  30.26 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  32.51 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  30.36 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  36.18 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  30.36 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  35.53 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  29.27 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  29.8 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  30.25 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  28.86 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  28.86 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  29.06 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  27.52 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  34.21 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  33.51 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  35.66 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  35.66 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  31.99 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  28.19 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  26.59 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
304 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  26.34 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  32.47 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  28.68 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  27.56 
 
 
323 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  31.88 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  31.82 
 
 
309 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  27.54 
 
 
327 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  27.12 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  29.13 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  30.73 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  29.31 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  27.86 
 
 
272 aa  59.3  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  29.3 
 
 
277 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  29.34 
 
 
314 aa  58.9  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  29.31 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  29.71 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  29.69 
 
 
320 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  27.51 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  31.58 
 
 
312 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  29.65 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  27.34 
 
 
305 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  28.74 
 
 
304 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  27.98 
 
 
305 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  27.73 
 
 
280 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  25.66 
 
 
302 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  28.51 
 
 
294 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  29.54 
 
 
297 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  28.74 
 
 
312 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  26.27 
 
 
304 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  28.35 
 
 
283 aa  55.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  29.23 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  30.63 
 
 
296 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  31.41 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  28.88 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  29.38 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  29.24 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  25.11 
 
 
307 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  29.47 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  29.95 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  29.47 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  29.47 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  29.47 
 
 
295 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  29.47 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  26.52 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  28.83 
 
 
312 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  29.33 
 
 
282 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  28.05 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  28.78 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  26.27 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  28.8 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  31.21 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  29.02 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
296 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  27.54 
 
 
302 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  28.74 
 
 
315 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  29.38 
 
 
290 aa  49.3  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  28.35 
 
 
279 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  26.2 
 
 
303 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  26.56 
 
 
318 aa  48.9  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>