165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1610 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  100 
 
 
288 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  53.24 
 
 
283 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  52.17 
 
 
277 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  51.44 
 
 
279 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  50.9 
 
 
285 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  44.33 
 
 
274 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  44.64 
 
 
273 aa  225  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  42.96 
 
 
274 aa  224  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  43.06 
 
 
276 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  44.17 
 
 
276 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  44.53 
 
 
261 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  41.84 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  41.07 
 
 
275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  41.49 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  38.16 
 
 
278 aa  209  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  40 
 
 
276 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  39.15 
 
 
287 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  47.14 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  39.36 
 
 
276 aa  198  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  41.13 
 
 
278 aa  195  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  40.57 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  40.57 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  40.21 
 
 
279 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  40.21 
 
 
279 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  40.21 
 
 
279 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  40.21 
 
 
279 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  39.64 
 
 
280 aa  190  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  39.01 
 
 
277 aa  186  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  40.71 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  40.67 
 
 
296 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  37.06 
 
 
288 aa  178  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  42.36 
 
 
290 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  42.36 
 
 
290 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  37.81 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  39.18 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  39.18 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  39.18 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  39.18 
 
 
310 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  38.83 
 
 
290 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  38.83 
 
 
296 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  36.07 
 
 
270 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  38.3 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  39.66 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  39.66 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  35.21 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  37.14 
 
 
272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  39.31 
 
 
291 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  38.43 
 
 
275 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  37.97 
 
 
290 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  37.4 
 
 
286 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  35.94 
 
 
290 aa  158  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  34.36 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  32.18 
 
 
291 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
278 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  37.61 
 
 
278 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  33.9 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  35.02 
 
 
295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  31.13 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  31.56 
 
 
278 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  36.63 
 
 
282 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  33.56 
 
 
290 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  32.75 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  27.4 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  31.84 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  29.47 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  30.79 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  28.85 
 
 
299 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  30.07 
 
 
291 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  32.12 
 
 
319 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  31.8 
 
 
319 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  28.38 
 
 
318 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
318 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  29.47 
 
 
298 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  29.47 
 
 
298 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  29.14 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  27.4 
 
 
307 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  27.92 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  27.39 
 
 
295 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  31.3 
 
 
302 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  26.54 
 
 
335 aa  92.4  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  27.06 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  27.81 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  26.07 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  28.17 
 
 
281 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  27.12 
 
 
292 aa  85.5  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  27.14 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  24.83 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  29.33 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  26.54 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  26.91 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  26.25 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 
360 aa  77  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  27.22 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  27.19 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  28.4 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  24.37 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  26.46 
 
 
374 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  27 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>