128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1021 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1021  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3267  amidohydrolase 2  30.93 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000314139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  32.06 
 
 		 286 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3277  amidohydrolase 2  28.93 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000257981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5784  amidohydrolase 2  27.37 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3770  amidohydrolase 2  22.36 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115169  normal  0.264283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  31.22 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43937  predicted protein  27.06 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00956853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43770  predicted protein  26.83 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.02958  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  31.56 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5782  amidohydrolase 2  32.16 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  30.08 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  30.08 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  30.71 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  28.2 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  27.24 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  27.24 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  27.24 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  31.05 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  30.74 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  31.15 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  27.24 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  30.74 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  30.74 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  27.24 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  30.74 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3877  amidohydrolase 2  23.22 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  30.74 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  26.83 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  29.17 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  25.38 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  27.2 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  24.9 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  27.41 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  27.41 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  25 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 290 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  26.07 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  27.97 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  22.58 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  27.89 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  28.5 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  27.69 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  26.86 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  25.98 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  27.43 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  27.27 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  28.1 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  27.54 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  27.54 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  27.54 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  27.54 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  27.54 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  24.47 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  28.8 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  27.98 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  27.54 
 
 		 368 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  27.54 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  25.18 
 
 		 266 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  27.53 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  23.43 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 290 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  28.69 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  24.56 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.62 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  20.7 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  22.41 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  23.17 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  23.72 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  23.46 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  24.17 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  22.76 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  25 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  23.37 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  24.88 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  27.22 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  27.42 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 322 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4067  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 373 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.186813  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  34.33 
 
 		 319 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  27.88 
 
 		 261 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  26.78 
 
 		 272 aa  45.8  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>