148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4016 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  100 
 
 		 276 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  53.65 
 
 		 278 aa  308  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  54.55 
 
 		 276 aa  301  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  51.65 
 
 		 275 aa  299  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  50.18 
 
 		 274 aa  288  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  48.55 
 
 		 276 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  44.4 
 
 		 287 aa  242  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  43.32 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  41.07 
 
 		 285 aa  215  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  41.22 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  40 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  37.23 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  39.51 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  39.16 
 
 		 290 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  39.35 
 
 		 277 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  38.99 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  37.76 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  37.76 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  37.41 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  37.41 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  37.06 
 
 		 296 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  37.65 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  37 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  37.2 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  37.91 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  35.94 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  36.46 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  36.97 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  36.96 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  36.84 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  37.09 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  35.84 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  36.4 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  35.13 
 
 		 276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  35.42 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  35.02 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  36.04 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  36.04 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  35.64 
 
 		 348 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  37.71 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  34.41 
 
 		 290 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  37.71 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  37.71 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  37.71 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  37.71 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  34.41 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  33.69 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  34.07 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  37.29 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  33.69 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  32.37 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  32.52 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  30.43 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  34.39 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  29.37 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  27.56 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  29.67 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  27.12 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  33.52 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  33.52 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  31.82 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  29.75 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  28.27 
 
 		 307 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  28.38 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  24.83 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  25.58 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  26.9 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  28.88 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  25.87 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 318 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 		 360 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 347 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  24.33 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  25 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  23.99 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  28.27 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  24.84 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  22.05 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  25.31 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  25.31 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  24.67 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  23.68 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  23.55 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  24.59 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  23.47 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  22.18 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  23.57 
 
 		 314 aa  72  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  22.4 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>