125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_36110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  90.57 
 
 		 319 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  68.46 
 
 		 313 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  53.61 
 
 		 292 aa  299  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  40.6 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  41.22 
 
 		 307 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  42.91 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  43.14 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  44.07 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  43.1 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  40.34 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  43.39 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  38.28 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  42.42 
 
 		 297 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  41.47 
 
 		 320 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  43.73 
 
 		 313 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  40.8 
 
 		 319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  40.8 
 
 		 319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  40.4 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  38.59 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  38.01 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  33.44 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  36.03 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  36.03 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  35.69 
 
 		 298 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  34.01 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  33.55 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  35 
 
 		 339 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  31.55 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  32.24 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  30.15 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  30.27 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  30.84 
 
 		 348 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  29.84 
 
 		 285 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  29.25 
 
 		 374 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  31.21 
 
 		 279 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  29.85 
 
 		 374 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  30.41 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  31.8 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  30.15 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  32.33 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  29.85 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  29.85 
 
 		 371 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  29.85 
 
 		 371 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  28.25 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  28.14 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  29.85 
 
 		 348 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  29.85 
 
 		 348 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  29.84 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 275 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  30.48 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  27.99 
 
 		 276 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  27.87 
 
 		 378 aa  96.3  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  31.08 
 
 		 277 aa  96.3  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 278 aa  89.4  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 276 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  28.38 
 
 		 283 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  29.1 
 
 		 274 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  33.5 
 
 		 261 aa  85.9  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  27.4 
 
 		 270 aa  85.9  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  29.32 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  25.99 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  27.55 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  25.18 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  25.8 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  29.29 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  29.35 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  29.69 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  27.95 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  30.8 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  26.19 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  26.91 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  26.76 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  30.8 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  30.8 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  30.8 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  30.8 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  30.8 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  21.5 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  31.92 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  30.94 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  30.94 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  25.89 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  25.58 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  23.55 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  25.68 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  28.2 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  26.91 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  27.51 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  30.87 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>