156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3732 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  83.04 
 
 
288 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  38.6 
 
 
291 aa  198  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  36.59 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  38.25 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  40.28 
 
 
285 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  36.97 
 
 
276 aa  175  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  34.29 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  35.23 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  36.59 
 
 
282 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  37.23 
 
 
277 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  33.92 
 
 
307 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  35.59 
 
 
278 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  35.19 
 
 
275 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  43.32 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  35.21 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  34.51 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  34.75 
 
 
278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  34.86 
 
 
274 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  34.52 
 
 
274 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  36.3 
 
 
273 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  31.44 
 
 
294 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  31.4 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  37.59 
 
 
279 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  32.98 
 
 
276 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  37.23 
 
 
279 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  37.23 
 
 
279 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  37.23 
 
 
279 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  37.23 
 
 
279 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  37.23 
 
 
279 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  33.45 
 
 
297 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  33.45 
 
 
280 aa  149  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  34.27 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  36.62 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  35.92 
 
 
276 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  36.88 
 
 
348 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  34.15 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  36.17 
 
 
276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  33.22 
 
 
286 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  34.04 
 
 
277 aa  136  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  36.56 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  33.11 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  32.27 
 
 
275 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  32.03 
 
 
287 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  32.64 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  33.55 
 
 
307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  35.71 
 
 
274 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  30.9 
 
 
318 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  33.44 
 
 
299 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  32.39 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  31.91 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  32.86 
 
 
278 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  31.93 
 
 
291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  31.77 
 
 
295 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  31.49 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  31.49 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  33.45 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  31.17 
 
 
298 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  35.84 
 
 
291 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  32.89 
 
 
296 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  31.49 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  33.11 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  33.11 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  31.8 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  30 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  32.13 
 
 
296 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  32.01 
 
 
310 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  29.84 
 
 
319 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  29.29 
 
 
270 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  30.56 
 
 
297 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  29.33 
 
 
297 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  30.94 
 
 
319 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  30.94 
 
 
319 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  32.09 
 
 
292 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  30.39 
 
 
322 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  29.84 
 
 
319 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  31.97 
 
 
295 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  30.29 
 
 
320 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  32.29 
 
 
291 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  32.29 
 
 
291 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
314 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  31 
 
 
290 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  31.87 
 
 
260 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  27.61 
 
 
335 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  28.2 
 
 
298 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  31.68 
 
 
313 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  31 
 
 
296 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  30.72 
 
 
313 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  28.62 
 
 
290 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  27.76 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  24.05 
 
 
378 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  27.92 
 
 
290 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  28.4 
 
 
374 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  28.62 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  27.87 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  29.36 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  27.63 
 
 
302 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  27.21 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 
360 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  31.05 
 
 
345 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>