181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1224 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  100 
 
 		 290 aa  587  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  96.9 
 
 		 290 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  84.14 
 
 		 290 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  61.86 
 
 		 291 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  61.86 
 
 		 291 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  61.86 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  55.07 
 
 		 270 aa  279  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  52.14 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  51.79 
 
 		 276 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  52.48 
 
 		 279 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  52.48 
 
 		 279 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  54.09 
 
 		 348 aa  262  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  51.43 
 
 		 276 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  52.13 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  52.13 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  52.13 
 
 		 279 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  52.13 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  52.35 
 
 		 275 aa  254  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  48.06 
 
 		 290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  47.78 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  46.4 
 
 		 277 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  48.2 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  42.03 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  44.02 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  42.05 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  44.56 
 
 		 283 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  45.23 
 
 		 278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  38.77 
 
 		 275 aa  189  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  42.36 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  40.85 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  38.57 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  40.35 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  36.04 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  32.98 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  38.6 
 
 		 285 aa  171  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  39.57 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  36.79 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  34.05 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  39.22 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  34.41 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  35.03 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  39.62 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  34.14 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  34.14 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  34.48 
 
 		 296 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  34.83 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  33.79 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  36.93 
 
 		 273 aa  142  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  36.79 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  30.07 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  30.69 
 
 		 281 aa  118  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  29.52 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  31.67 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  28.62 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  30.88 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  33.52 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  29.43 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  25.78 
 
 		 307 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  29.14 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  30.03 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  27.27 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  28.48 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  31.1 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  30.69 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  26.16 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  31.07 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  29.74 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  30.74 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  30.3 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  31.05 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  27.94 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  30.19 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  27.87 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  28.62 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  28.47 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  29.55 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  29.55 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  27.73 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  27.18 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  24.33 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09180  Amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  27.98 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  30.84 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  24.32 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1021  hypothetical protein  27.03 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  25.73 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  37.61 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  27.16 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  27.36 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>