123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1551 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  100 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  47.99 
 
 		 297 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  46.49 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  44.44 
 
 		 318 aa  255  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  44.11 
 
 		 297 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  43.43 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  43.1 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  41.22 
 
 		 319 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  40.88 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  39.46 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  43.62 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  43.62 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  43.62 
 
 		 298 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  37.75 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  41.95 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  38.13 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  40.2 
 
 		 290 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  35.43 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  36.61 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  40.13 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  37.04 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  37.29 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  37.58 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  37.42 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  38.16 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  38.16 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  37.71 
 
 		 320 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  33.66 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  32.78 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  33.43 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  35.14 
 
 		 339 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  34.11 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  32.84 
 
 		 371 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  32.84 
 
 		 371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  32.84 
 
 		 371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  31.86 
 
 		 348 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  31 
 
 		 349 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  32.84 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  33.55 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  32.54 
 
 		 374 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  27.83 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  32.24 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  30.46 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  32.12 
 
 		 279 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  29.88 
 
 		 348 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  33.56 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  34.22 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  34.22 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  34.22 
 
 		 279 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  34.22 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  34.22 
 
 		 279 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  34.22 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  30.75 
 
 		 348 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  31.33 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  29.88 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  30.45 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  30.45 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  29.55 
 
 		 387 aa  119  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  29.15 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  29.53 
 
 		 278 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  31.34 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  27.91 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  33.46 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  29.9 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  29.37 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  29.9 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  30.79 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  27.95 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  33.78 
 
 		 274 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  31.17 
 
 		 291 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  30.26 
 
 		 286 aa  108  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  30.42 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  27.61 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  31.99 
 
 		 348 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  29.63 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  30.2 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  24.83 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  28.47 
 
 		 270 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 378 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  28.2 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  27.18 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  25.93 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  28.25 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 296 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  28.67 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  29.47 
 
 		 283 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  28.9 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  30.25 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  30.25 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  27.65 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  32.47 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>