128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3275 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  50.84 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  49.33 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  49.67 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  48.99 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  48.31 
 
 		 318 aa  279  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  47.99 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  45.3 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  45.3 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  44.97 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  40.94 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  40.6 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  43.62 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  39.13 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  40.73 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  41.61 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  37.29 
 
 		 314 aa  208  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  38.1 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  38.67 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  35.81 
 
 		 322 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  36.39 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  35.62 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  34.12 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  39.7 
 
 		 339 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  34.12 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  33.78 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  33.78 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  33.11 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  39.1 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  37.84 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  34.39 
 
 		 348 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  37.39 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  34.72 
 
 		 374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  34.72 
 
 		 374 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  35.71 
 
 		 347 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  34.42 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  34.42 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  34.12 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  33.89 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  31.23 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  32.04 
 
 		 348 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  29.25 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  29.97 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  31.19 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  30.43 
 
 		 282 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  31.13 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  30.63 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  30.56 
 
 		 348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  30.56 
 
 		 348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  30.43 
 
 		 285 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  30.27 
 
 		 348 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  29.76 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  26.87 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  29.19 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  28.81 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  28.76 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  33.77 
 
 		 261 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  29.39 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  28.8 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  28.08 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  27.12 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  29.49 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  25.51 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  27.42 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  30.3 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  28.23 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  31.15 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  27.42 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  27.89 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  27.89 
 
 		 387 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  28.52 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  28.52 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  28.52 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  28.52 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  27.42 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  28.52 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  28.52 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  27.61 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  26.1 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 291 aa  97.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  26.69 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  27.36 
 
 		 348 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01740  amidohydrolase 2  25 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  27.78 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  24.58 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  24.25 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>