178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5475 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  100 
 
 		 290 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  84.14 
 
 		 290 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  82.76 
 
 		 290 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  63.1 
 
 		 291 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  63.1 
 
 		 291 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  63.1 
 
 		 291 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  53.09 
 
 		 270 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  50.35 
 
 		 276 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  49.65 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  49.65 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  49.65 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  49.29 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  49.29 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  49.29 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  49.29 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  51.62 
 
 		 348 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  48.23 
 
 		 276 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  49.82 
 
 		 275 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  46.76 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  44.93 
 
 		 277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  43.11 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  42.4 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  39.49 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  45.58 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  44.6 
 
 		 272 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  43.24 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  40.21 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  40.57 
 
 		 285 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  39.15 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  40 
 
 		 283 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  39.29 
 
 		 287 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  36.17 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  39.93 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  37.97 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  37.09 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  35.11 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  31.01 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  33.69 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  38.03 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  35.59 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  38.43 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  37.93 
 
 		 261 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  33.67 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  32.88 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  32.88 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  33.22 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  33.22 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  33.56 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  32.53 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  30.34 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  32.39 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  30.74 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  37.5 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  29.24 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  33.61 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  31.13 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  30.88 
 
 		 292 aa  99  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  35.34 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  28.46 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  29.27 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  29.24 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  28.43 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  25.83 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  30 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  31.56 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  27.18 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  30.59 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  32.47 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  28.64 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  28.04 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  32.89 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  28.43 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  30.97 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  28.9 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  29.96 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  28.41 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  29.85 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  28.48 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  29.48 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  29.59 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  28.48 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  28.81 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  28.81 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  29.52 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  31.54 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  27.54 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  31.8 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  29.8 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  26.43 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  31.54 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  30.85 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1021  hypothetical protein  27.08 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  28.21 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  29.67 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>