120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6032 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  100 
 
 		 348 aa  716    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  83.57 
 
 		 348 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  83 
 
 		 348 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  83 
 
 		 348 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  83.29 
 
 		 348 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  53.78 
 
 		 335 aa  358  7e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  51.47 
 
 		 347 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  44.71 
 
 		 371 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  44.71 
 
 		 371 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  44.71 
 
 		 371 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  46.27 
 
 		 374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  45.81 
 
 		 374 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  48.15 
 
 		 337 aa  292  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  46.81 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  45.19 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  36.81 
 
 		 349 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  38.01 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  32.93 
 
 		 318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  29.88 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  29.76 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  30.54 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  29.09 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  28.78 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  29.38 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  29.04 
 
 		 297 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  27.89 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  27.89 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  28.14 
 
 		 319 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  28.09 
 
 		 290 aa  99.8  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  27.68 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  34.62 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  28.36 
 
 		 313 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  26.18 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  32.17 
 
 		 378 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  28.49 
 
 		 292 aa  93.2  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  30.45 
 
 		 279 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 288 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  27.25 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  27.84 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  25.85 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  28.22 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  27.22 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  27.22 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  23.55 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  23.25 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  25.07 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  28.45 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  25.46 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  30.39 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  26.06 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  24.22 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  29.71 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  26.05 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  23.99 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  27.99 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  24.27 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  24.27 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  24.25 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  26.59 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  31.2 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  30.52 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  25.07 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  24.16 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  31.11 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  22.15 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  24.41 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  24.36 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  29.73 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  26.15 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  24.78 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  23.01 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  30 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  28.89 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  30 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  30 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  30 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  22.04 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  26.86 
 
 		 275 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  27.87 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  26.13 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  23.1 
 
 		 275 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>