132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0397 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  100 
 
 
274 aa  535  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  64.49 
 
 
277 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  57.04 
 
 
285 aa  275  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  54.87 
 
 
279 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  47.5 
 
 
288 aa  232  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  51.37 
 
 
261 aa  221  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  44.77 
 
 
283 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  42.81 
 
 
275 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  47.29 
 
 
273 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  41.22 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  38.41 
 
 
276 aa  193  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  40.94 
 
 
287 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  37.41 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  43.57 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  37.41 
 
 
276 aa  181  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  39.49 
 
 
274 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  34.42 
 
 
278 aa  179  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  41.9 
 
 
296 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  41.9 
 
 
296 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  41.9 
 
 
290 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  41.9 
 
 
296 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  42.51 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  41.55 
 
 
310 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  38.43 
 
 
278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  37.86 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  41.2 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  40.86 
 
 
275 aa  158  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  38.93 
 
 
276 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  35.71 
 
 
285 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  40.43 
 
 
277 aa  152  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  40.43 
 
 
275 aa  152  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  38.21 
 
 
286 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  36.2 
 
 
276 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  39.86 
 
 
272 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  35.48 
 
 
276 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  38.65 
 
 
291 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  38.65 
 
 
291 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  36.33 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  38.65 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  36.71 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  37.72 
 
 
278 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  38.21 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  38.77 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  36.08 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  34.78 
 
 
307 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
290 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  37.63 
 
 
348 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  30.42 
 
 
291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  32.51 
 
 
278 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  32.51 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  37.14 
 
 
279 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  37.14 
 
 
279 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  37.14 
 
 
279 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  37.14 
 
 
279 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  37.14 
 
 
279 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
292 aa  125  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  36.79 
 
 
279 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  30.14 
 
 
304 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  30.64 
 
 
297 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  32.4 
 
 
282 aa  118  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  32.43 
 
 
318 aa  118  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  36.59 
 
 
302 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  31.69 
 
 
278 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  31.67 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  31.36 
 
 
282 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  38.37 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  32.08 
 
 
290 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
281 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  31.89 
 
 
297 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  31.88 
 
 
281 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  30.23 
 
 
297 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  30.2 
 
 
313 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  30.72 
 
 
299 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  31.88 
 
 
319 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  23.47 
 
 
294 aa  99  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  32.34 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  29.32 
 
 
335 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  30.79 
 
 
298 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  30.75 
 
 
347 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  30.13 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  31.56 
 
 
298 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  30.87 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  30.13 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  27.52 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  36.88 
 
 
291 aa  89  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  29.52 
 
 
348 aa  89  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  28.38 
 
 
292 aa  89  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  29.5 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  29.5 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  29.5 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  30.77 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  29.22 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  30.23 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  31.33 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  31.13 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  25.24 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  29.79 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  30 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  31.33 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>