125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3060 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  100 
 
 
322 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  85.27 
 
 
319 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  85.27 
 
 
319 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  84.86 
 
 
320 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  88.37 
 
 
313 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  89.7 
 
 
313 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  51.59 
 
 
314 aa  299  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  44.07 
 
 
319 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  44.07 
 
 
319 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  35.81 
 
 
297 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  39.19 
 
 
292 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  38.24 
 
 
313 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  37.04 
 
 
307 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  37.79 
 
 
297 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  37.42 
 
 
295 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  35.37 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  38.41 
 
 
299 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  36.45 
 
 
297 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  36.45 
 
 
297 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  33.89 
 
 
318 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  33.44 
 
 
290 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  36.54 
 
 
298 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  36.54 
 
 
298 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  36.33 
 
 
298 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  35.33 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  30.36 
 
 
303 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  32.26 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  30.72 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  30.39 
 
 
285 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  32.32 
 
 
275 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  31.64 
 
 
307 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  32.35 
 
 
296 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  27.52 
 
 
276 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  32.03 
 
 
296 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  26.6 
 
 
275 aa  99  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  32.03 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  31.37 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  29.56 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  29.73 
 
 
276 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  31.37 
 
 
296 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  31.37 
 
 
296 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  27.36 
 
 
335 aa  96.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  27.73 
 
 
387 aa  95.9  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  31.27 
 
 
347 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  27.36 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  29.74 
 
 
290 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  30 
 
 
279 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  30.46 
 
 
277 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  23.49 
 
 
274 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  28.76 
 
 
274 aa  90.1  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  31.08 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  31.73 
 
 
261 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  28.2 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  28.42 
 
 
299 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  28.52 
 
 
282 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  28.96 
 
 
374 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
335 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  28.38 
 
 
276 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  28.96 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  28.48 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  30.32 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  29.45 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  32.66 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  28.05 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  27.54 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  27.54 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  25 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  27.84 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  29.47 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  31.92 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  26.53 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  31.21 
 
 
260 aa  79  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  26.25 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  25.83 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  29.74 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  27.36 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  20.88 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  28.95 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  28.65 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  25.07 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  27.06 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  29.08 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  26.7 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  30 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  23.14 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  26.35 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  29.66 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  29.64 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  26.1 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  26.1 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  27.55 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  29.66 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  29.66 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  29.66 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  29.66 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  29.87 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  30 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  29.66 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>