170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4296 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  100 
 
 		 276 aa  557  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  77.9 
 
 		 276 aa  447  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  77.54 
 
 		 276 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  68.36 
 
 		 279 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  68.36 
 
 		 279 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  68 
 
 		 279 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  68 
 
 		 279 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  67.64 
 
 		 279 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  68 
 
 		 279 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  68.25 
 
 		 348 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  50.72 
 
 		 278 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  51.81 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  55.6 
 
 		 290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  50.18 
 
 		 291 aa  254  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  50.36 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  51.43 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  49.64 
 
 		 290 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  48.23 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  44.04 
 
 		 275 aa  224  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  49.31 
 
 		 291 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  47.5 
 
 		 278 aa  224  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  48.41 
 
 		 291 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  48.41 
 
 		 291 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  43.48 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  42.34 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  42.59 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  45.29 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  42.29 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  44.24 
 
 		 279 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  40.79 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  41.58 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  39.36 
 
 		 288 aa  198  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  39.71 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  39.21 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  36.46 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  38.71 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  36.46 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  39.29 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  40.29 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  39.1 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  39.15 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  38.06 
 
 		 296 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  38.06 
 
 		 296 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  38.06 
 
 		 310 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  37.37 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  37.37 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  36.24 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  39.3 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  36.11 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  36.62 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  38.21 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  31.82 
 
 		 291 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  36.17 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  32.97 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  31.87 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  34.29 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  31.01 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  31.33 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  30.69 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  33 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  29.66 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  29.63 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  30.43 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  31.27 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  31.67 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  30.31 
 
 		 291 aa  108  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  31.67 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  31.67 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  30 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  29.05 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  29.05 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  30.07 
 
 		 297 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  29.73 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  30.46 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  30.74 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  31.16 
 
 		 260 aa  95.5  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  26.46 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  25.17 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  30.07 
 
 		 313 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  31.14 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  28.96 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  25.61 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  28.38 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  28.38 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  27.48 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  27.86 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  24.23 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  26.49 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  26.35 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  25.46 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  24.23 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01740  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>