131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1423 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  100 
 
 
280 aa  563  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  43.48 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  43.12 
 
 
276 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  41.88 
 
 
275 aa  228  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  39.27 
 
 
278 aa  227  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  43.32 
 
 
276 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  43.17 
 
 
276 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  40.21 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  42.29 
 
 
276 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  42.5 
 
 
276 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  42.5 
 
 
276 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  40.14 
 
 
274 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  43.37 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  42.27 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  42.27 
 
 
296 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  42.27 
 
 
296 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  42.61 
 
 
296 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  42.61 
 
 
296 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  41.37 
 
 
279 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  39.64 
 
 
288 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  42.35 
 
 
275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  41.64 
 
 
296 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  42.21 
 
 
291 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  39.78 
 
 
278 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  41.77 
 
 
270 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  39.59 
 
 
295 aa  185  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  41.06 
 
 
286 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  39.78 
 
 
285 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  41.99 
 
 
275 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  40.21 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  40.28 
 
 
290 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  40.7 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  40.93 
 
 
348 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  40.85 
 
 
291 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  40.57 
 
 
277 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  38.95 
 
 
290 aa  168  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  39.64 
 
 
279 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  40.14 
 
 
291 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  40.14 
 
 
291 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  39.64 
 
 
279 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  39.29 
 
 
279 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  39.29 
 
 
279 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  38.49 
 
 
277 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  39.29 
 
 
279 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  39.29 
 
 
279 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  41.63 
 
 
261 aa  165  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  43.32 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  38.43 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  39.21 
 
 
290 aa  162  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  34.41 
 
 
288 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  37.37 
 
 
278 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  40.21 
 
 
272 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  33.45 
 
 
285 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  33.69 
 
 
278 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  34.77 
 
 
281 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  31.23 
 
 
282 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  30.18 
 
 
282 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  31.32 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  36.07 
 
 
291 aa  129  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  31.32 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  29.23 
 
 
291 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  27.99 
 
 
304 aa  122  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  31.83 
 
 
291 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  33.67 
 
 
298 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  33 
 
 
298 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  33 
 
 
298 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  33.44 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  27.46 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  31.34 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  28.32 
 
 
307 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  30.56 
 
 
299 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  30.87 
 
 
318 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  31.02 
 
 
260 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  28.86 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  26.91 
 
 
307 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
335 aa  93.2  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  25.5 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  26.76 
 
 
297 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  29.03 
 
 
281 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  27.83 
 
 
374 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  23.99 
 
 
294 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  28.13 
 
 
374 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  28.63 
 
 
360 aa  86.3  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  25.75 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  27.52 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  30.1 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  23.93 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  30.16 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  27.22 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  27.22 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  27.48 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  29.47 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  30.26 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  29.51 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  29.51 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
314 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  29.57 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>