113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6104 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  100 
 
 		 349 aa  726    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  40.3 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  37.39 
 
 		 348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  37.39 
 
 		 348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  37.39 
 
 		 348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  36.81 
 
 		 348 aa  245  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  37.08 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  36.39 
 
 		 371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  36.39 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  36.39 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  36.59 
 
 		 335 aa  232  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  36.53 
 
 		 374 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  36.53 
 
 		 374 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  39.21 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  37.66 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  35.92 
 
 		 348 aa  208  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  31.23 
 
 		 297 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  31 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  31.19 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  30.3 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  27.47 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  24.55 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  28.53 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  27.49 
 
 		 303 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  27.3 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  26.75 
 
 		 304 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 279 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  26.8 
 
 		 319 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  26.8 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  25.15 
 
 		 297 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 285 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  29.03 
 
 		 261 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  27.71 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  27.71 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  27.71 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  28.68 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  25.96 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  27.71 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  30.95 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  26.03 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  23.05 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  22.4 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  23.75 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  25.15 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  23.68 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  23.75 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  25 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  23.93 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  24.89 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  23.68 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  23.98 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  23.68 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  29.56 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  20.44 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  24.84 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  29.56 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  23.47 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  21.3 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  21.07 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  22.26 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  29.56 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  29.56 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  29.56 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  30.05 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  25.97 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  27.17 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  26.1 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  25.41 
 
 		 276 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  27.12 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  26.01 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  22.83 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  23.84 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  27.8 
 
 		 281 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  21.88 
 
 		 276 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  23.76 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 278 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  26.32 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  24.49 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  23.37 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01740  amidohydrolase 2  28.07 
 
 		 291 aa  50.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  29.05 
 
 		 279 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  29.05 
 
 		 279 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  29.05 
 
 		 279 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>