113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44258 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  100 
 
 
387 aa  810    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  29.55 
 
 
307 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  27.89 
 
 
297 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  27.97 
 
 
290 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  26.53 
 
 
314 aa  96.3  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  27.73 
 
 
322 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  27.61 
 
 
313 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  27.25 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  28.22 
 
 
298 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  28.22 
 
 
298 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  28.83 
 
 
298 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  27.35 
 
 
297 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  28.95 
 
 
319 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  27.81 
 
 
298 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  28.95 
 
 
319 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  28 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  27.51 
 
 
318 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  28.15 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  29.26 
 
 
320 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  25.8 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  33.51 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  27.69 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  25.97 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  25.97 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
279 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  26.33 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  27.61 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  25.31 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  25.45 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  25.79 
 
 
292 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  30.93 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  30.93 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  27.03 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  24.18 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  30.65 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  32.98 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  31.25 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  32.46 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  26.06 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  25 
 
 
275 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  28.21 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  27.97 
 
 
288 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  33.16 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  31.94 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  31.94 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  25.78 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  26.04 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  25.48 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  30.27 
 
 
261 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  25 
 
 
290 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  24.93 
 
 
348 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  23.35 
 
 
288 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  24.93 
 
 
348 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  23.42 
 
 
286 aa  63.5  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
276 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
276 aa  62.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  26.05 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  24.69 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  23.83 
 
 
270 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  25.87 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  29.18 
 
 
295 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  27.32 
 
 
277 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  25.46 
 
 
347 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  24.05 
 
 
278 aa  60.1  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
287 aa  60.1  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  28.49 
 
 
276 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  27.37 
 
 
276 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  32.43 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  26.26 
 
 
276 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
274 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  27.07 
 
 
285 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  23.94 
 
 
318 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  24.81 
 
 
274 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
290 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  26.34 
 
 
278 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  23.91 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  25.4 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  22.78 
 
 
277 aa  53.9  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  24.52 
 
 
290 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  29.63 
 
 
304 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  24.49 
 
 
349 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  19.53 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  23.27 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  25.11 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  23.08 
 
 
283 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  26.2 
 
 
282 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  21.8 
 
 
282 aa  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  26.78 
 
 
278 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
276 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  25.13 
 
 
290 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  26.59 
 
 
291 aa  47.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 
360 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  22.33 
 
 
260 aa  46.2  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>