119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4879 on replicon NC_013442
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  100 
 
 		 345 aa  703    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  39.34 
 
 		 378 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  35.96 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  33.56 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  32.65 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  30.07 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  30.72 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  30.42 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  33.74 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  31.15 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  31.96 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  32.71 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  37.24 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  31.15 
 
 		 297 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  30.45 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  34.62 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  30.42 
 
 		 374 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  32.3 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  34.69 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  35.57 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  34.18 
 
 		 348 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  34.18 
 
 		 348 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 374 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  27.09 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  31.05 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  31.45 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  31.45 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  30.96 
 
 		 298 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  29.27 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  29.27 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  28.68 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  36.05 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  28.91 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  30.25 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  28.12 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  29.35 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  28.12 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  35.47 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  28.84 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  30.42 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  27.1 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  28.29 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  28.29 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  29.58 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  31.2 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  29.55 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  26.61 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  29.55 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  29.55 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  29.55 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  29.55 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  29.55 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  29.7 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  29.6 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  27.61 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  30.73 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  25.42 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  27.92 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  29.31 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  23.55 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  28.24 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  31.93 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  29.19 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  29.19 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  27.49 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  25.73 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  29.95 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  27.14 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  28.03 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  30.72 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  30.61 
 
 		 296 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  28.19 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  25.86 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  27.98 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  28.99 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  28.86 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  30.73 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  31.43 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  30.63 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  29.67 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  29.67 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  28.9 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  26.75 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>