169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6311 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  100 
 
 
291 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  97.25 
 
 
291 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  97.25 
 
 
291 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  63.1 
 
 
290 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  61.86 
 
 
290 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  60.48 
 
 
290 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  56.83 
 
 
270 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  56.58 
 
 
275 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  48.41 
 
 
276 aa  242  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  48.41 
 
 
276 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  49.31 
 
 
276 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  49.3 
 
 
279 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  49.3 
 
 
279 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  48.95 
 
 
279 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  48.95 
 
 
279 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  48.95 
 
 
279 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  48.95 
 
 
279 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  49.12 
 
 
348 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  47.54 
 
 
290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  45.91 
 
 
277 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  42.5 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  47.95 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  42.86 
 
 
278 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  47.2 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  43.78 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  48.24 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  37.76 
 
 
276 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  42.66 
 
 
280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  40 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  36.79 
 
 
274 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  37.77 
 
 
275 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  43.11 
 
 
275 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  39.31 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  41.9 
 
 
285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  36.4 
 
 
276 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  40.49 
 
 
279 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  39.93 
 
 
283 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  39.16 
 
 
296 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  37.85 
 
 
296 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  37.85 
 
 
296 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  34.4 
 
 
276 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  37.59 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  37.85 
 
 
296 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  39.02 
 
 
277 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
310 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  40.3 
 
 
261 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  36.62 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  38.52 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  36.55 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  36.11 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  37 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  27.03 
 
 
307 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  30.26 
 
 
291 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  29.62 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  30.34 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  37.04 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  30.19 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  29.32 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  29.47 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  30.14 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  33.85 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  29.62 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  31.56 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  29.9 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  29.9 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  34.21 
 
 
278 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  29.74 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  32.02 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  28.69 
 
 
297 aa  85.9  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  31.11 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  31.95 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  29.81 
 
 
297 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  31.92 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  31.27 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  33.22 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  30.19 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  31.18 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  29.97 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  26.15 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  28.34 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  31.92 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  31.92 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  28.01 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  30.83 
 
 
302 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  27.74 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  25.97 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
335 aa  68.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  27.36 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  23.15 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  29.39 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  29.6 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  31.98 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  28.35 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  42.53 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  27.88 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  30.33 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>