123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1036 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  100 
 
 		 318 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  48.31 
 
 		 297 aa  279  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  44.44 
 
 		 307 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  45.85 
 
 		 299 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  46.46 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  45.95 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  44.33 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  41 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  40.34 
 
 		 319 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  40.34 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  37.34 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  39.26 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  39.04 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  37.16 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  37.71 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  37.37 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  37.37 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  35.39 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  36.7 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  36.27 
 
 		 292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  37.91 
 
 		 302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  37.73 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  35.94 
 
 		 347 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  33.55 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  32.53 
 
 		 348 aa  139  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  33.55 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  33.55 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  32.57 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  32.67 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  35.14 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  33 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  32.63 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  32.89 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  34.01 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  32.93 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  32.43 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  32.89 
 
 		 288 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  31.19 
 
 		 349 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  32.16 
 
 		 374 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  32.27 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  31.96 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  33.53 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  31.44 
 
 		 348 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  31.44 
 
 		 348 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  31.44 
 
 		 348 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  31.87 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  31.87 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  31.87 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  31.82 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  28.9 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  31.78 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  30.61 
 
 		 275 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  30.33 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  31.42 
 
 		 278 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  31.8 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  29.62 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  29.83 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  28.38 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  31 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  28.38 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  30.56 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  29.97 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  29.49 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  29.89 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  32.09 
 
 		 274 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  30.87 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  35.98 
 
 		 261 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  28.38 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  37.24 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 276 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1174  hypothetical protein  26.83 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.021087  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  29.9 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01740  amidohydrolase 2  26 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  29.03 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  31.58 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  32.68 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  30.46 
 
 		 276 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  27.18 
 
 		 274 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  32.13 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  29.55 
 
 		 270 aa  96.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  29.8 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  32.13 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  32.13 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 278 aa  96.3  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  32.42 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  29.24 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  31.49 
 
 		 290 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  31.05 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  31.07 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  35.77 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  31.91 
 
 		 277 aa  89.7  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  27.51 
 
 		 387 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  31.46 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  25.96 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  29.35 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  29.43 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  30.69 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  30.11 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>