138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0875 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  100 
 
 
275 aa  542  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  49.82 
 
 
272 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  44.04 
 
 
276 aa  224  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  43.32 
 
 
276 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  43.32 
 
 
276 aa  215  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  46.64 
 
 
278 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  44.4 
 
 
279 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  44.4 
 
 
279 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  44.73 
 
 
348 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  44.04 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  44.04 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  44.04 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  44.04 
 
 
279 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  41.73 
 
 
270 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  42.46 
 
 
278 aa  185  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  41.67 
 
 
275 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  42.6 
 
 
277 aa  182  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  41.99 
 
 
280 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  36.13 
 
 
274 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  37.23 
 
 
286 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  40.21 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  40.85 
 
 
290 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  42.11 
 
 
285 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  39.86 
 
 
290 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  38.71 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  38.06 
 
 
291 aa  165  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  37.72 
 
 
287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  43.11 
 
 
291 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  43.11 
 
 
291 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  38.43 
 
 
288 aa  161  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  43.11 
 
 
291 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  33.94 
 
 
274 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
275 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  38.35 
 
 
283 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  36.46 
 
 
277 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  40.38 
 
 
261 aa  148  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  37.28 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  32.38 
 
 
288 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
276 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  36.18 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  35.84 
 
 
296 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  35.49 
 
 
296 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  35.49 
 
 
296 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  32.01 
 
 
276 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  37.37 
 
 
292 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  36.3 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  35.15 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  40.43 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  32.27 
 
 
285 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  28.62 
 
 
278 aa  132  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  30.43 
 
 
276 aa  132  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  35.05 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  30.47 
 
 
278 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  33.91 
 
 
290 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
291 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  30.11 
 
 
278 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  29.58 
 
 
282 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  33.22 
 
 
295 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  31.8 
 
 
318 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  29.66 
 
 
290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  29.91 
 
 
281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  35.64 
 
 
291 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  29.72 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  31.46 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
307 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  30.14 
 
 
260 aa  85.9  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  29.6 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  27.36 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  24.45 
 
 
304 aa  79  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  24.82 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  28.31 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  26.94 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  26.69 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  28.12 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  26.94 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  22.26 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  25.33 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  29.11 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  28.28 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  28.28 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  26.01 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  29.1 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  28.62 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  30 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  25.16 
 
 
349 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  28.74 
 
 
319 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  27.63 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  25.51 
 
 
319 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  26.77 
 
 
378 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  27.61 
 
 
320 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1174  hypothetical protein  24.14 
 
 
318 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.021087  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  29.38 
 
 
348 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  30.63 
 
 
347 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>