131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6812 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  100 
 
 
291 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  38.83 
 
 
288 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  38.6 
 
 
285 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
285 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  31.82 
 
 
278 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  32.17 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  34.36 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  32.76 
 
 
282 aa  145  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  38.17 
 
 
275 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  29.93 
 
 
278 aa  142  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  29.07 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  31.23 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  32.75 
 
 
279 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  30.93 
 
 
348 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  31.82 
 
 
276 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  30.77 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  31.47 
 
 
276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  30.77 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  30.77 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  30.69 
 
 
279 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  30.77 
 
 
279 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  30.69 
 
 
279 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  31.12 
 
 
278 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  34.05 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  29.43 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  29.82 
 
 
277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  31.47 
 
 
283 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  29.51 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  29.79 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  34.39 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  34.21 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  29.58 
 
 
274 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  30.27 
 
 
291 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  31.4 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  29.72 
 
 
278 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
275 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  29.23 
 
 
280 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  31.29 
 
 
307 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  27.82 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  30.77 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  28.43 
 
 
318 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  27.92 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  25.89 
 
 
294 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  32.8 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  28.33 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  31.15 
 
 
297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  29.53 
 
 
291 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  26.76 
 
 
299 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
275 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  29.97 
 
 
318 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  28 
 
 
297 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  28.17 
 
 
260 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  32.07 
 
 
291 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  32.07 
 
 
291 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  27.96 
 
 
297 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  31.52 
 
 
291 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  32.6 
 
 
290 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  29.52 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  27.21 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  26.86 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  31.13 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  29.07 
 
 
290 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  28 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  28.48 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
298 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  29.55 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  23.94 
 
 
270 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  26.54 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  26.26 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  26.26 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  26.94 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  28.2 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  22.64 
 
 
292 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  26.26 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  25.79 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  26.09 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  28.93 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  28.93 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  25.08 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  22.84 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  26.14 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  28.03 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  25.52 
 
 
292 aa  79  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  28.41 
 
 
313 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  23.57 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  24.67 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  22.98 
 
 
335 aa  75.5  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  26.86 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  23.45 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  24.17 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0537  hypothetical protein  21.05 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0233364  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  23.95 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63908  L-rhamnono-gamma-lactonase  22.97 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.689755 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>