72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63908 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_63908  L-rhamnono-gamma-lactonase  100 
 
 
336 aa  699    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.689755 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  34.75 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  26.34 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  22.69 
 
 
285 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  26.77 
 
 
285 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  21.07 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  26.14 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  26.14 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  28.4 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  22.97 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  26.14 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  25.99 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  24.02 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  24.42 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
277 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  23.41 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  24.76 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  22.6 
 
 
261 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  24.76 
 
 
278 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  25.49 
 
 
291 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  26.97 
 
 
307 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  23.86 
 
 
290 aa  59.3  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  24.38 
 
 
282 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  25.49 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  25.49 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  23.5 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  25 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  22.12 
 
 
278 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  25.5 
 
 
276 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  25.25 
 
 
274 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  23.27 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  25.5 
 
 
276 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  26.5 
 
 
291 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  24.55 
 
 
304 aa  56.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  22.08 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  20.83 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  22.76 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  24.39 
 
 
291 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
339 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  23.18 
 
 
297 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  24.47 
 
 
318 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  24.12 
 
 
290 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  23.5 
 
 
278 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  21.33 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  29.63 
 
 
281 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  21.11 
 
 
272 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
276 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  26.21 
 
 
278 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  25 
 
 
290 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  25.36 
 
 
294 aa  50.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  25.54 
 
 
286 aa  50.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  21.81 
 
 
322 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  22.89 
 
 
270 aa  49.3  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  21.21 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  23.68 
 
 
292 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  21.67 
 
 
295 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  23.04 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  21.21 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  18.97 
 
 
335 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  27.43 
 
 
348 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
348 aa  46.2  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  21.46 
 
 
275 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
314 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>