164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5317 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  100 
 
 		 291 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  50.18 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  48.94 
 
 		 276 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  51.94 
 
 		 279 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  51.94 
 
 		 279 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  48.59 
 
 		 276 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  51.55 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  51.55 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  51.55 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  51.55 
 
 		 279 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  49.82 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  46.5 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  46.85 
 
 		 286 aa  219  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  47.78 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  43.62 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  46.76 
 
 		 290 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  41.05 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  45.42 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  46.76 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  47.26 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  47.26 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  47.95 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  40.7 
 
 		 277 aa  199  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  46.32 
 
 		 278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  43.4 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  40.7 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  42.21 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  39.08 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  39.37 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  36.84 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  34.02 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  34.74 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  38.06 
 
 		 275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  38.46 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  34.27 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  36.93 
 
 		 279 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  34.39 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  35.05 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  37.36 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  36.61 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  36.27 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  36.27 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  37.8 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  36.27 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  36.27 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  35.07 
 
 		 277 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  36.3 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  35.05 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  36.77 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  32.18 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  32.64 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  34.36 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  32.16 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  31.76 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  36.71 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  31.49 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  31.17 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  29.53 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  31.63 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  28.91 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  29.69 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  32.63 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  29.93 
 
 		 281 aa  95.5  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  28.62 
 
 		 318 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  29.01 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 278 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  30.39 
 
 		 319 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  30.39 
 
 		 319 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  25.59 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  30.39 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  24.92 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  29.45 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  28.43 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  25.34 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  30 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  27.09 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  26.76 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  26.44 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  29.1 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  30 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  27.36 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  25.6 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  26.32 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  31.79 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  28.68 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>