139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0412 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  100 
 
 
274 aa  571  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  54.18 
 
 
275 aa  321  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  55.51 
 
 
278 aa  317  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  52.92 
 
 
276 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  50.18 
 
 
276 aa  288  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  47.83 
 
 
276 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  43.12 
 
 
287 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  43.48 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  43.01 
 
 
274 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  44.33 
 
 
288 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  43.32 
 
 
285 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  42.03 
 
 
279 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  42.5 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  38.85 
 
 
277 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  39.64 
 
 
270 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  40.36 
 
 
273 aa  189  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  36.92 
 
 
276 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  36.46 
 
 
276 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  37.28 
 
 
276 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  38.82 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  40.86 
 
 
274 aa  181  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  36.56 
 
 
279 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  36.56 
 
 
279 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  36.56 
 
 
279 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  36.56 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  36.56 
 
 
279 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  36.56 
 
 
279 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  36.46 
 
 
295 aa  178  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  35.87 
 
 
278 aa  178  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  35.66 
 
 
296 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  35.66 
 
 
296 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  35.31 
 
 
310 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  35.86 
 
 
286 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  35.66 
 
 
290 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  35.66 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  35.31 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  36.56 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  36.04 
 
 
290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  37.14 
 
 
348 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  36.79 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  36.04 
 
 
290 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  34.62 
 
 
296 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  36.79 
 
 
291 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  36.79 
 
 
291 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  34.27 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  34.75 
 
 
290 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  33.92 
 
 
288 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  34.17 
 
 
272 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  34.86 
 
 
285 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  34.78 
 
 
275 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  33.94 
 
 
275 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  36 
 
 
290 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  34.63 
 
 
278 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  34.05 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  27.96 
 
 
278 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  29.11 
 
 
282 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  27.96 
 
 
278 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  30.36 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  25.81 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  27.43 
 
 
304 aa  115  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  26.52 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  27.09 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  27.09 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  26.76 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  26.96 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  30.39 
 
 
292 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  30.29 
 
 
291 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  26.17 
 
 
298 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  27.04 
 
 
291 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  28.87 
 
 
281 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  30 
 
 
307 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
307 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  30.51 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  25.33 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  23.49 
 
 
318 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  23.49 
 
 
322 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  27.05 
 
 
281 aa  89  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  23.47 
 
 
294 aa  89  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  27.44 
 
 
360 aa  86.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  24.08 
 
 
313 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  22.82 
 
 
297 aa  85.9  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  24.41 
 
 
313 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
297 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  24.08 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  24.08 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  24.92 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  23.23 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  23.75 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  25 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63908  L-rhamnono-gamma-lactonase  26.34 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.689755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  22.56 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  23.65 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  25.25 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  24.83 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  27.01 
 
 
378 aa  75.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  22.3 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  23.25 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  23.89 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>