121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2438 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  100 
 
 		 292 aa  595  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  53.61 
 
 		 319 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  52.23 
 
 		 313 aa  298  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  53.61 
 
 		 319 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  37.58 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  36.39 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  40.48 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  39.19 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  36.61 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  40.54 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  39.8 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  38.78 
 
 		 319 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  38.78 
 
 		 319 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  35.45 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  36.27 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  35.12 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  34.01 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  34.11 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  33.22 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  29.87 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  31 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  32.08 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  34.02 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  31.56 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  31.56 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  31.56 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  30.07 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  31.23 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  31.1 
 
 		 347 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  30.24 
 
 		 371 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  30.24 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  30.24 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  32.33 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  29.46 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  29.64 
 
 		 374 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  27.56 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  29.34 
 
 		 374 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  29.84 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  27.95 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  31 
 
 		 339 aa  99  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  29.33 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  28.67 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  28.49 
 
 		 348 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  27.96 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  28.08 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  27.18 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  26.94 
 
 		 282 aa  87  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 299 aa  85.9  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  27.12 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  27.16 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  23.75 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  25.96 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  24.83 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  26.15 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  31.55 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  23.99 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  25.95 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  25.67 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  25.67 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  25.07 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  26.91 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  27.95 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  26.1 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  26.15 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  26.89 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  25.79 
 
 		 387 aa  75.9  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  26.91 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  26.91 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  26.49 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  23.89 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1174  hypothetical protein  25.09 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.021087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  27.36 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  24.75 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  27.15 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  29.03 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  26.12 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  25.39 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  30 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  27.67 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  20.14 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  25.25 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  28.99 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  25.19 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  39.81 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  24.01 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>