166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3372 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  100 
 
 
261 aa  497  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  51.76 
 
 
279 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  44.53 
 
 
288 aa  218  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  47.66 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  46.09 
 
 
285 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  42.35 
 
 
275 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  42.02 
 
 
283 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  51.37 
 
 
274 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  41.34 
 
 
274 aa  188  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  35.69 
 
 
278 aa  185  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  37.65 
 
 
276 aa  185  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  42.58 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  38.82 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  41.89 
 
 
288 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  40.54 
 
 
273 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  39.17 
 
 
276 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  38.13 
 
 
276 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  41.63 
 
 
280 aa  165  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  42.19 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  43.32 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  39.3 
 
 
276 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  37.36 
 
 
291 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  37.19 
 
 
286 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  41.25 
 
 
348 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  36.25 
 
 
278 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  42.29 
 
 
279 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  37.89 
 
 
275 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  42.29 
 
 
279 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  41.57 
 
 
290 aa  151  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  42.29 
 
 
279 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  42.29 
 
 
279 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  42.29 
 
 
279 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  42.29 
 
 
279 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  40.38 
 
 
275 aa  148  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  39.62 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  38.04 
 
 
278 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  37.2 
 
 
276 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  37.2 
 
 
276 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  40.08 
 
 
272 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  41.95 
 
 
296 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  38.08 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  41.33 
 
 
296 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  36.96 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  41.49 
 
 
291 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  41.49 
 
 
291 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  39.92 
 
 
291 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  40.74 
 
 
296 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  40.74 
 
 
296 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  41.51 
 
 
290 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  40.96 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  41.89 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  37.93 
 
 
290 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  43.7 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  34.21 
 
 
291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  32.3 
 
 
278 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  33.77 
 
 
297 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  32.69 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  34.31 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  32.95 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  34.95 
 
 
282 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  33.46 
 
 
307 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  38.63 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  35.93 
 
 
295 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  32.48 
 
 
318 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  32.09 
 
 
291 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  36.28 
 
 
299 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  35.22 
 
 
304 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  34.04 
 
 
347 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  28.63 
 
 
282 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  35.98 
 
 
318 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  35.04 
 
 
281 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  30.98 
 
 
290 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  30.73 
 
 
307 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  34.56 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  32.3 
 
 
339 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  30.48 
 
 
297 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  30.08 
 
 
295 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
303 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  30.13 
 
 
371 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  30.13 
 
 
371 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  28.46 
 
 
294 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  30.13 
 
 
371 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  33.5 
 
 
319 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  33.09 
 
 
313 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  31.72 
 
 
322 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  29.14 
 
 
313 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  31.8 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  33.5 
 
 
319 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  31.8 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  29.54 
 
 
348 aa  85.5  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  29.03 
 
 
349 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  31.8 
 
 
298 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  32.34 
 
 
313 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  32.22 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  31.46 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  29.58 
 
 
374 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  31.8 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  30.14 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  30.39 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>