174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1549 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  100 
 
 
275 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  51.81 
 
 
276 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  50.36 
 
 
276 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  50.72 
 
 
276 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  50.92 
 
 
270 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  56.58 
 
 
291 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  55.52 
 
 
291 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  55.52 
 
 
291 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  52.35 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  49.08 
 
 
277 aa  241  7e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  49.09 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  51.26 
 
 
290 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  50.55 
 
 
348 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  49.45 
 
 
279 aa  234  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  49.45 
 
 
279 aa  234  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  49.09 
 
 
279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  49.09 
 
 
279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  49.09 
 
 
279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  48.73 
 
 
279 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  49.82 
 
 
290 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  49.64 
 
 
272 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  43.27 
 
 
274 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  48.39 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  43.62 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  42.91 
 
 
278 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  44.26 
 
 
286 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  38.91 
 
 
287 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  42.35 
 
 
280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  41.67 
 
 
275 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  36.23 
 
 
276 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  45.12 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  37.59 
 
 
275 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  39.57 
 
 
279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  41.22 
 
 
277 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  37.09 
 
 
276 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  34.06 
 
 
276 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  38.3 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  31.39 
 
 
278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  39.49 
 
 
285 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  34.78 
 
 
274 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  37.89 
 
 
261 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  35.92 
 
 
296 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  35.92 
 
 
296 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  35.92 
 
 
310 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  35.56 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  35.21 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  34.86 
 
 
290 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  36.43 
 
 
273 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  35.31 
 
 
295 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  35.21 
 
 
296 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  40.86 
 
 
274 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  31.69 
 
 
288 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  31.91 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  34.63 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  31.58 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  32.32 
 
 
322 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
291 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  32.89 
 
 
313 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  29.9 
 
 
299 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  27.11 
 
 
307 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  28.99 
 
 
281 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  28.87 
 
 
290 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  29.08 
 
 
278 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  32.21 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  31.97 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  28.11 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  26.3 
 
 
282 aa  93.2  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  29.77 
 
 
298 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  31.91 
 
 
320 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  26.06 
 
 
278 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  36.04 
 
 
260 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  28 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  25.87 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  28.23 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  31.77 
 
 
319 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  31.77 
 
 
319 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  25.17 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
307 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  29.67 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  29.67 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  29.67 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  27.53 
 
 
291 aa  86.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  27.76 
 
 
299 aa  86.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  30.69 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  29.36 
 
 
374 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  24.04 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  25.83 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  27.91 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  29.05 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  26.54 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  26.91 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  28.44 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  25 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
371 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  26.6 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  24.43 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  34.78 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  26.1 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>