170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03263 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  100 
 
 
290 aa  568  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  55.23 
 
 
276 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  53.26 
 
 
276 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  52.54 
 
 
276 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  53.74 
 
 
279 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  53.74 
 
 
279 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  53.74 
 
 
279 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  53.74 
 
 
279 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  53.74 
 
 
279 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  53.74 
 
 
279 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  54.71 
 
 
348 aa  255  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  49.09 
 
 
275 aa  248  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  48.06 
 
 
290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  49.82 
 
 
272 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  47 
 
 
290 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  47.08 
 
 
270 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  47.54 
 
 
291 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  47.18 
 
 
291 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  47.18 
 
 
291 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  45.29 
 
 
277 aa  223  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  48.2 
 
 
278 aa  221  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  43.4 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  43.11 
 
 
290 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  42.12 
 
 
274 aa  208  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  44.44 
 
 
286 aa  208  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  41.94 
 
 
278 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  38.99 
 
 
276 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  39.78 
 
 
275 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  41.94 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  39.72 
 
 
283 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  39.21 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  37.09 
 
 
275 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  35.94 
 
 
288 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  31.9 
 
 
278 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  38.54 
 
 
310 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  36 
 
 
274 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  39.15 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  38.54 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  38.54 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  36.77 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  41.57 
 
 
261 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  40.07 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
296 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  37.2 
 
 
296 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  38.49 
 
 
296 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  39.86 
 
 
277 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  33.82 
 
 
276 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  32.37 
 
 
276 aa  153  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  36.46 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  32.5 
 
 
288 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  38.77 
 
 
274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  34.13 
 
 
295 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  33.45 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  36.4 
 
 
292 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  36.17 
 
 
291 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  28.09 
 
 
291 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  29.24 
 
 
290 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  28.26 
 
 
281 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  31.9 
 
 
281 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  29.43 
 
 
307 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  27.96 
 
 
278 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  25.77 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  26.33 
 
 
278 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  30.48 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  26.76 
 
 
278 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  30.46 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  32.01 
 
 
298 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  32.01 
 
 
298 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
304 aa  87  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  31.99 
 
 
322 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  31.65 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  28.2 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  31.68 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  33 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  27.67 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  28.48 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  32.35 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  25.42 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  28.81 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  32.2 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  32.2 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  26.69 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3277  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  30.39 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  26.85 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  26.97 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5782  amidohydrolase 2  33.6 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  29.96 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  27.69 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  27.61 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  24.32 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  27.09 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  27.96 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  27.86 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  26.78 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1067  hypothetical protein  22.1 
 
 
367 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0263007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>