119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5782 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5782  amidohydrolase 2  100 
 
 
265 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1021  hypothetical protein  32.16 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  29.8 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43770  predicted protein  29.73 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.02958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  30.36 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  30.6 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  31.67 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3277  amidohydrolase 2  26.56 
 
 
293 aa  72  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257981 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  29.23 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  34.4 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  28.77 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  30.69 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  30.69 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  31.6 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43937  predicted protein  28.42 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00956853  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  29.02 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  31.9 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  31.9 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  31.9 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  31.9 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  32.26 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  31.9 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5784  amidohydrolase 2  28.81 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  27.59 
 
 
324 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  27.59 
 
 
327 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  27.59 
 
 
330 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  27.59 
 
 
330 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  27.59 
 
 
330 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  27.59 
 
 
330 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  27.59 
 
 
368 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  28.02 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  26.16 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3267  amidohydrolase 2  28.74 
 
 
329 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  unclonable  0.0000314139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
260 aa  58.9  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  27.92 
 
 
296 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  30.71 
 
 
303 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  27.24 
 
 
308 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  32.14 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  28.34 
 
 
279 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  30.37 
 
 
295 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  29.8 
 
 
313 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4793  amidohydrolase 2  33.69 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  26.51 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  29.39 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  27.6 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
280 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  26.33 
 
 
281 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  27.74 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3770  amidohydrolase 2  25.21 
 
 
309 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115169  normal  0.264283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  31.11 
 
 
273 aa  52.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  30.22 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  30.61 
 
 
339 aa  52  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  31.98 
 
 
319 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  31.98 
 
 
319 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  25.62 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  31.16 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  28.82 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  28.02 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  35.29 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  29.37 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  24.72 
 
 
288 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3877  amidohydrolase 2  28.46 
 
 
289 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  31.75 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  23.97 
 
 
277 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
290 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  30.54 
 
 
322 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  30.92 
 
 
275 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  31.54 
 
 
313 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  27.64 
 
 
278 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  30.52 
 
 
320 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  29.76 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  26.78 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  27.8 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
288 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  34.13 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  31 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  28.19 
 
 
279 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  29.88 
 
 
291 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  24.02 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  29.36 
 
 
290 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  25.36 
 
 
297 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  25.95 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  26.16 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  27.82 
 
 
319 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  26.96 
 
 
309 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  30.94 
 
 
285 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  31.17 
 
 
261 aa  45.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  26.13 
 
 
278 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  30.91 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  30.86 
 
 
318 aa  45.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  30.91 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  30.91 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  27.61 
 
 
319 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  28.97 
 
 
314 aa  45.4  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  30.91 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  32.5 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  30.91 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  26.98 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>