61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3877 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3877  amidohydrolase 2  100 
 
 
289 aa  585  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1804  hypothetical protein  26.69 
 
 
329 aa  79  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43770  predicted protein  27.73 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.02958  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43937  predicted protein  26.35 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00956853  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  27.36 
 
 
285 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  26.37 
 
 
277 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  25.28 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  24.15 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1021  hypothetical protein  23.22 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643261  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4793  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
284 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  27.37 
 
 
279 aa  58.9  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  27.2 
 
 
272 aa  58.9  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3267  amidohydrolase 2  28.52 
 
 
329 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  unclonable  0.0000314139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  27.57 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3277  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  25 
 
 
288 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5784  amidohydrolase 2  22.42 
 
 
283 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  24.62 
 
 
277 aa  52.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  27.91 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  23.91 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  25.09 
 
 
288 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  25 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  25 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  28.44 
 
 
312 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  24.81 
 
 
270 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  25.35 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.31 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  24.53 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  24.53 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  24.53 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  24.53 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  24.53 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
276 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  22.34 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  24.53 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  24.62 
 
 
277 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  27.38 
 
 
300 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  23.57 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  28.09 
 
 
295 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  23.9 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  28.68 
 
 
289 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
276 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  31.4 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  26.07 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  28.3 
 
 
312 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  25.99 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5782  amidohydrolase 2  28.46 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  24.44 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  34.04 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  22.26 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  26.07 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  22.93 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3770  amidohydrolase 2  24.18 
 
 
309 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115169  normal  0.264283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  24.07 
 
 
279 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
278 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  26.05 
 
 
278 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  22.91 
 
 
282 aa  42.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>