151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4918 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  100 
 
 
285 aa  565  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  61.87 
 
 
277 aa  332  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  56.23 
 
 
279 aa  296  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  50.9 
 
 
288 aa  275  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  48.03 
 
 
283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  55.96 
 
 
274 aa  245  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  47.65 
 
 
273 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  42.6 
 
 
275 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  43.32 
 
 
274 aa  223  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  43.53 
 
 
274 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  42.29 
 
 
276 aa  218  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  41.07 
 
 
276 aa  215  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  41.88 
 
 
276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  44.13 
 
 
287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  40.14 
 
 
278 aa  212  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  46.09 
 
 
261 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  40.49 
 
 
288 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  41.94 
 
 
278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  39.78 
 
 
280 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  40.28 
 
 
285 aa  178  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  41.18 
 
 
296 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  40.48 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  40.48 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  43.01 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  40.14 
 
 
310 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  39.8 
 
 
296 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  39.8 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  40.48 
 
 
290 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  40.57 
 
 
290 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  39.29 
 
 
276 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  42.11 
 
 
275 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  39.29 
 
 
276 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  40.5 
 
 
277 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  40.21 
 
 
276 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  41.28 
 
 
279 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  41.28 
 
 
279 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  41.28 
 
 
279 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  41.28 
 
 
279 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  41.28 
 
 
279 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  41.55 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  38.52 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  37.55 
 
 
270 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  40.93 
 
 
279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  41.32 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  41.32 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  38.21 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  38.6 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  39.49 
 
 
275 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  42.09 
 
 
348 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  35.05 
 
 
291 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  39.43 
 
 
286 aa  155  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  39.15 
 
 
290 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
291 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  40.82 
 
 
291 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  34.93 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  30.43 
 
 
297 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  32.38 
 
 
281 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  30.95 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  29.7 
 
 
318 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  29.55 
 
 
282 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  30.56 
 
 
278 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  29.11 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  29.37 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  32.98 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  33.88 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  29.47 
 
 
299 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  25.65 
 
 
304 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  32.23 
 
 
307 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  30.56 
 
 
318 aa  105  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  30.92 
 
 
298 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  30.92 
 
 
298 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  31.37 
 
 
347 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  30.72 
 
 
298 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  30.26 
 
 
298 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  29.21 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  32.42 
 
 
360 aa  96.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  26.77 
 
 
297 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  28.21 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  35.4 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  25.68 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  26.36 
 
 
335 aa  92.4  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  28.36 
 
 
348 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  29.87 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  29.43 
 
 
374 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  29.03 
 
 
313 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  29.72 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  26.09 
 
 
297 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  28.44 
 
 
371 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  28.44 
 
 
371 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  28.53 
 
 
374 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  26.54 
 
 
349 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  31 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  28.25 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  27.93 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  28.96 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  27.61 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  27.95 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  27.27 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  25.61 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  27.95 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>