115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0947 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  51.68 
 
 		 347 aa  315  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  48.46 
 
 		 348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  48.46 
 
 		 348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  48.15 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  48.77 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  48.46 
 
 		 348 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  49.07 
 
 		 339 aa  288  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  46.2 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  46.39 
 
 		 371 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  46.39 
 
 		 371 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  46.08 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  45.59 
 
 		 374 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  45.2 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  44.57 
 
 		 348 aa  272  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  39.21 
 
 		 349 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  40.55 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  30.93 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  31.45 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  32.12 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  31.63 
 
 		 297 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  31.21 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  31.21 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  31.21 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  31.78 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  31.21 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  30.27 
 
 		 297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  32.63 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  28.49 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  32.33 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  28.41 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  27.93 
 
 		 318 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  33.2 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  30.24 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 288 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  27.61 
 
 		 277 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  32.22 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  28.28 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  27.02 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  26.89 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  27.41 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  27.95 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  27.71 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  27.71 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  27.25 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  23.68 
 
 		 276 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  27.24 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  28.01 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  26.2 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  21.74 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  27.41 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  25.7 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  24.7 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  27.44 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  25.2 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  31.78 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  31.78 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  27.05 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  30.93 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  23.01 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  27.54 
 
 		 261 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  27.48 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  28.32 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  28.95 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  27.8 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  24.14 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  28.89 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  24.53 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  25 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  27.06 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  25.55 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  26.23 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  22.19 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  29.38 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  26.9 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  29.06 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  26.9 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  25.87 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  26.01 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  26.75 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  30.64 
 
 		 279 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  30.64 
 
 		 279 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  30.64 
 
 		 279 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  25.75 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>