120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4264 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  100 
 
 		 378 aa  754    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  39.62 
 
 		 345 aa  222  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  34.81 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 347 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  34.13 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  29.78 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  36.15 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  30.16 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  31.14 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  30.38 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  30.38 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  30.38 
 
 		 348 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  29.22 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  29.62 
 
 		 288 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  30.97 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  29.49 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  32.17 
 
 		 348 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  32.61 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  32.61 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  32.42 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  31.06 
 
 		 290 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  32.61 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  24.52 
 
 		 285 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  28.42 
 
 		 319 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  31.6 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  31.6 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 297 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  31.6 
 
 		 298 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  27.55 
 
 		 297 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  27.6 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  29.62 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  31.6 
 
 		 298 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  29.31 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  28.91 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  30.95 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  27.12 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  26.1 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  30.53 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  29.2 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  27.61 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  27.92 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  30.27 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  27.18 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  26.89 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  22.46 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  30.48 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  22.8 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 274 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 291 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  28.04 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  29.06 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  28.7 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  33.11 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  27.34 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  24.17 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  31.61 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  29.72 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  28.12 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  21.24 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  25.46 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  27.92 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  34.24 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  33.7 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  28.31 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  30.5 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  29.28 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 275 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  29.47 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  27.53 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  31.54 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  26.37 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  27.01 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  26.53 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  26.53 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  26.36 
 
 		 283 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  24.42 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  24.66 
 
 		 276 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  27.07 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  28.3 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  28.44 
 
 		 292 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  25.71 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  28.25 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  28.25 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  25.57 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  28.25 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  28.25 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  28.25 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  28.25 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  31.98 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>