121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3207 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  100 
 
 		 313 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  96.49 
 
 		 313 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  88.37 
 
 		 322 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  88.74 
 
 		 320 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  86.75 
 
 		 319 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  86.75 
 
 		 319 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  53.85 
 
 		 314 aa  305  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  44.07 
 
 		 319 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  43.39 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  40.48 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  34.12 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  37.42 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  37.62 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  37.71 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  35.55 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  36.79 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  37.54 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  34.78 
 
 		 297 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  34.78 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  36 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  36 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  36 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  32.67 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  32.33 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  35 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  32.68 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  30.42 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  29.77 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  32.89 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  29.26 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  32.44 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  31.68 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  28.19 
 
 		 276 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  30.79 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  31.19 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  32.15 
 
 		 296 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  32.89 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  27.73 
 
 		 387 aa  95.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  29.25 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  30.87 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  30.87 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  30.07 
 
 		 276 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  30.87 
 
 		 279 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  30.55 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  30.43 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  25.84 
 
 		 275 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  33.09 
 
 		 261 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  33.78 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  28.23 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  27.06 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  31.76 
 
 		 278 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  31.17 
 
 		 277 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  24.08 
 
 		 274 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  27.61 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  29.1 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  30 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  27.06 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  29.18 
 
 		 282 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  27.7 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  27.7 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  27.89 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  28.03 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  28.17 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  27.12 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  32.67 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  27.78 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  28.15 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  28.4 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  28.04 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  21.22 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  30.74 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  31.88 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  29.63 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  31.95 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  31.63 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  31.63 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  29.63 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  29.63 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  29.63 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  29.63 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  30.54 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  29.63 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  28.62 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  29.77 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  29.24 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  31 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  22.82 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  29.57 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  23.68 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  30 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  28.84 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>