166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6470 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  100 
 
 
291 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  100 
 
 
291 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  97.25 
 
 
291 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  63.1 
 
 
290 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  61.86 
 
 
290 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  60.48 
 
 
290 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  56.83 
 
 
270 aa  289  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  55.52 
 
 
275 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  48.76 
 
 
276 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  48.76 
 
 
276 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  48.41 
 
 
276 aa  234  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  49.65 
 
 
279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  49.3 
 
 
279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  49.65 
 
 
279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  49.3 
 
 
279 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  49.3 
 
 
279 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  49.3 
 
 
279 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  49.47 
 
 
348 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  47.18 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  45.2 
 
 
277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  47.26 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  41.79 
 
 
274 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  44.18 
 
 
286 aa  201  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  41.81 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  46.85 
 
 
272 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  48.59 
 
 
278 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  38.11 
 
 
276 aa  195  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  37.41 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  41.96 
 
 
280 aa  182  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  39.3 
 
 
287 aa  181  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  36.79 
 
 
274 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  43.11 
 
 
275 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  39.66 
 
 
288 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
278 aa  172  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  41.67 
 
 
285 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  39.79 
 
 
279 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  36.04 
 
 
276 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  40.62 
 
 
283 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  36.9 
 
 
290 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  38.11 
 
 
296 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  37.15 
 
 
296 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  34.04 
 
 
276 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  37.15 
 
 
296 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  41.91 
 
 
261 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  36.81 
 
 
296 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  38.33 
 
 
277 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  37.15 
 
 
296 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  36.81 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  38.52 
 
 
274 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  36.62 
 
 
273 aa  132  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  36.11 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  32.17 
 
 
288 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  32.87 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  30.77 
 
 
291 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  30.25 
 
 
307 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  26.76 
 
 
307 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  30.69 
 
 
292 aa  95.5  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  31.56 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  30.14 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  29.46 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  29.6 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  35.45 
 
 
282 aa  89  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  30.38 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  29.55 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  28.27 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  29.49 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  29.02 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  29.07 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  29.07 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  31.63 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  32.11 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  28.43 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  30.94 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  31.72 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  30.94 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  31.05 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  32.9 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  30.19 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  28.62 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  28.03 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  31.35 
 
 
278 aa  79  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  31.6 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  31.6 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  29.34 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  30.83 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  28.01 
 
 
337 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  25.32 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  27.36 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  26.44 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  29.39 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  22.36 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  44.83 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  27.71 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  27.03 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  28.25 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  29.17 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  28.35 
 
 
339 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  30.74 
 
 
280 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>