123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3402 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  100 
 
 		 298 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  92.62 
 
 		 298 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  91.28 
 
 		 298 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  91.28 
 
 		 298 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  55.67 
 
 		 299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  53.02 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  53.02 
 
 		 297 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  53.02 
 
 		 297 aa  301  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  43.62 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  41.95 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  37.54 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  36.7 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  36.3 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  38.14 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  33.77 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  33.44 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  36.24 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  35.87 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  35.02 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  34.01 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  35.33 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  35 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  35.33 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  31.99 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  32.74 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  32.24 
 
 		 335 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  34 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  30.51 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  34.22 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  34.22 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  33 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  28.19 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  35.24 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  31.35 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  31.23 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  33.44 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  29.72 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  34.32 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  31.02 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  33.99 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  33.99 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  33.99 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  31.92 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  29.38 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  29.37 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  33.99 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  29.97 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  31.83 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  28.09 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  33.99 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  26.17 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  31.53 
 
 		 374 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  33.22 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  31.6 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  35.27 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  28.2 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  30.63 
 
 		 371 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  26.85 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  33.82 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  33.82 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  29.24 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  28.9 
 
 		 273 aa  99.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  30.26 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  31.89 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  27.18 
 
 		 278 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 348 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1174  hypothetical protein  23.48 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.021087  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  29.14 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  29.67 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01740  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  21.89 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  29.77 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  28.76 
 
 		 274 aa  92.8  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  27.61 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  27.86 
 
 		 348 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  29 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  27.81 
 
 		 387 aa  89.4  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  31.27 
 
 		 378 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  25.59 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  28.01 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  32.22 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  28.28 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  30.25 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  27.64 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  29.62 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  26.86 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  27.71 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  30.56 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  25.42 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  25.68 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  28.43 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  28.43 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>