94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1174 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1174  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  660    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.021087  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  39.13 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01740  amidohydrolase 2  35.76 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  27.05 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  27.36 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  25.84 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  26.83 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  26.5 
 
 		 278 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  23.48 
 
 		 298 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 298 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 298 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  26.02 
 
 		 278 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 273 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  24.39 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  25.61 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  23.97 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  20.92 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  23.63 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  22.63 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  24.7 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  24.23 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  24.09 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  24.14 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  22.53 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  21.84 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  22.35 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  24.61 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  22.57 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  22.84 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  23.89 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  25.47 
 
 		 348 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  20.9 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  25.27 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  24.33 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  21.95 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  26.85 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  23.62 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  23.65 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  23.65 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  22.63 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  22.26 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  22.26 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  22.94 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  24.71 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  24.71 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  24.71 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  24.71 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  24.71 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  24.71 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  20.92 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  22.58 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  24.16 
 
 		 276 aa  52.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  24.55 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1067  hypothetical protein  21.98 
 
 		 367 aa  50.4  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0263007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  20.83 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  27.45 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  23.29 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  22.99 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  22.99 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  22.49 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  19.82 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  22.16 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  22.89 
 
 		 371 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  20.41 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  22.89 
 
 		 371 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  22.89 
 
 		 371 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  20.95 
 
 		 260 aa  45.8  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  22.69 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  21.77 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  22.49 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  23.37 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  24.72 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  22.78 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1447  hypothetical protein  18.97 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  19.54 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  26.4 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  23.7 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>