119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5345 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  87.97 
 
 		 371 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  97.86 
 
 		 374 aa  723    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  87.97 
 
 		 371 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  86.63 
 
 		 371 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  100 
 
 		 374 aa  765    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  62.2 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  48.65 
 
 		 335 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  45.81 
 
 		 348 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  49.07 
 
 		 339 aa  297  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  45.21 
 
 		 348 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  44.84 
 
 		 348 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  44.84 
 
 		 348 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  43.95 
 
 		 348 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  45.59 
 
 		 337 aa  281  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  44.51 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  45.05 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  36.53 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  34.72 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  32.54 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  31.79 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  33.46 
 
 		 299 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  31.32 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  32.99 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  30.58 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  31.97 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  31.53 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  29.25 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  29.57 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  29.64 
 
 		 292 aa  106  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  30.06 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  31.14 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  32.31 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  26.63 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  29.25 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  30.42 
 
 		 345 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  28.62 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  28.23 
 
 		 279 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  27.41 
 
 		 288 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  27.14 
 
 		 303 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  27.83 
 
 		 280 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  28.96 
 
 		 322 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  28.53 
 
 		 285 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  28.04 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  27.5 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  29.36 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  25.55 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  30.14 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  29.24 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  27.89 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  27.02 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  26.63 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  26.88 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  24.1 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  25.85 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 290 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  27.35 
 
 		 313 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  26.65 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  26.65 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  22.57 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  24.25 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  26.49 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  25.78 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  27.66 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  26.1 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  25.85 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  26.07 
 
 		 307 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  25.15 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 278 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  23.93 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  22.19 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  27.2 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  25.15 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  25.67 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  26.83 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  22.18 
 
 		 278 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  24.87 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 291 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  25.24 
 
 		 270 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  25.55 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1174  hypothetical protein  26.51 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.021087  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  25 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01740  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  23.32 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  24.01 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>